More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0812 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0812  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.237121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  54.39 
 
 		 275 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  54.42 
 
 		 277 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  55.59 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  53.31 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  55.67 
 
 		 280 aa  301  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  53 
 
 		 275 aa  301  8.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  54.93 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  54.93 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  53.52 
 
 		 275 aa  298  8e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  53.17 
 
 		 275 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  54.04 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  53.87 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  52.46 
 
 		 276 aa  295  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  53.85 
 
 		 276 aa  295  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  53.33 
 
 		 276 aa  293  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  54.2 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  53.15 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  54.09 
 
 		 274 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  54.09 
 
 		 274 aa  292  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  54.09 
 
 		 274 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  53.74 
 
 		 273 aa  292  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  52.8 
 
 		 276 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  54.9 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  54.7 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  53.74 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  53.74 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  53.15 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  53.15 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  53.17 
 
 		 275 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  53.87 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  52.28 
 
 		 276 aa  288  7e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2166  ribosomal protein L2  56.33 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000491264  normal  0.227842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  53.38 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  53.38 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  53.02 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  52.78 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  52.78 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  52.46 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  51.74 
 
 		 287 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0429  50S ribosomal protein L2  51.43 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000081496  decreased coverage  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  50 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  56.33 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  56.33 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  52.28 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  52.61 
 
 		 279 aa  285  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  50.7 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  51.04 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  57.32 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  52.11 
 
 		 274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  51.75 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  50.7 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  52.1 
 
 		 277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  51.74 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  51.59 
 
 		 275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  50.18 
 
 		 273 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  52.45 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  52.45 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  53.01 
 
 		 277 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  51.75 
 
 		 278 aa  281  9e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  49.65 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  51.75 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  51.75 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  51.06 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  50 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  51.24 
 
 		 287 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  54.84 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  53.88 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3992  ribosomal protein L2  52.98 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  52.3 
 
 		 287 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  52.14 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  52.3 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  51.94 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  52.63 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  56.67 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  49.82 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0408  50S ribosomal protein L2  50 
 
 		 275 aa  276  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000019918  normal  0.14889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>