More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0803 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0803  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000201599  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  56.67 
 
 
183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 
179 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 
180 aa  203  9e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
182 aa  200  9e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  52.81 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
178 aa  200  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 
183 aa  198  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  51.12 
 
 
180 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
180 aa  198  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 
196 aa  197  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
179 aa  197  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
179 aa  197  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  197  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  52.81 
 
 
184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  55.56 
 
 
189 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 
179 aa  195  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 
179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  49.44 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  194  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
179 aa  194  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
178 aa  194  7e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
178 aa  194  8.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
179 aa  193  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  52.25 
 
 
180 aa  193  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 
191 aa  193  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  53.11 
 
 
186 aa  192  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
179 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1034  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
179 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000106866  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
193 aa  193  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
184 aa  193  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  48.89 
 
 
182 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 
193 aa  192  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  51.96 
 
 
191 aa  192  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  53.33 
 
 
191 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  52.81 
 
 
180 aa  192  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  191  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  51.96 
 
 
192 aa  191  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  51.7 
 
 
180 aa  191  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
180 aa  191  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  191  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  51.7 
 
 
192 aa  191  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  51.38 
 
 
184 aa  191  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2053  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  190  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00300411  normal  0.056988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  51.74 
 
 
180 aa  190  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  190  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  53.63 
 
 
190 aa  190  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
180 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
180 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  53.67 
 
 
189 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  51.12 
 
 
179 aa  189  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
180 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 
179 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  51.67 
 
 
194 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
179 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
180 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  49.44 
 
 
178 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  47.19 
 
 
196 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 
179 aa  189  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 
187 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
192 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  48.6 
 
 
179 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 
188 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  49.44 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0672  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  51.67 
 
 
189 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  188  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 
179 aa  188  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  49.72 
 
 
179 aa  188  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  49.44 
 
 
179 aa  187  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 
180 aa  188  5e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  47.46 
 
 
179 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  47.46 
 
 
179 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 
183 aa  188  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
179 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  48.31 
 
 
220 aa  187  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  50.28 
 
 
184 aa  187  5.999999999999999e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 
179 aa  187  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0301  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 
195 aa  187  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.433186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  48.88 
 
 
179 aa  187  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  51.69 
 
 
193 aa  187  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>