More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0228 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0228  MesJ/Ycf62 family protein  100 
 
 
321 aa  657    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  33.33 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4744  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.2 
 
 
346 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  34.63 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381977  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3082  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30528  predicted protein  30.34 
 
 
714 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000519848  normal  0.264814 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0531  hypothetical protein  32.08 
 
 
431 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00156827  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0544  hypothetical protein  32.08 
 
 
431 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000216418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.37 
 
 
326 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.37 
 
 
326 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.43 
 
 
509 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.74 
 
 
454 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0012  putative cell-cycle protein, MesJ/Ycf62 family  28.67 
 
 
421 aa  106  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0148  MesJ/Ycf62 family protein  32.4 
 
 
432 aa  105  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  35.26 
 
 
326 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  30.74 
 
 
458 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1786  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.92 
 
 
321 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0434  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.54 
 
 
331 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1626  PP-loop family protein  32.87 
 
 
321 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4939  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.85 
 
 
308 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.457595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1316  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.67 
 
 
346 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1738  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  32.71 
 
 
329 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  31.47 
 
 
336 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1446  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.41 
 
 
321 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.28 
 
 
336 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.53 
 
 
324 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.8 
 
 
335 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.379803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.67 
 
 
471 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1627  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.8 
 
 
335 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.89 
 
 
470 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.41 
 
 
436 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0074  MesJ-like protein  33.03 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48395  predicted protein  31.17 
 
 
770 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  29.58 
 
 
342 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.23 
 
 
464 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.23 
 
 
464 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  36.51 
 
 
454 aa  96.7  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.74 
 
 
388 aa  96.7  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3415  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.26 
 
 
432 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.9 
 
 
323 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0402  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  29.08 
 
 
430 aa  95.9  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260657  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl673  lysidine synthetase  30.65 
 
 
398 aa  95.1  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.29 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31371  predicted protein  29.95 
 
 
484 aa  95.5  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  32.87 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0666  cell cycle protein  29.78 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.03 
 
 
476 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.48 
 
 
476 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0014  MesJ/Ycf62 family protein  32.54 
 
 
424 aa  93.6  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1817  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.33 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19753  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.79 
 
 
241 aa  93.6  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0255  PP-loop family protein  30.91 
 
 
330 aa  92.8  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.765354  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.66 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4142  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.67 
 
 
347 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.33 
 
 
480 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1289  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.47 
 
 
436 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0181  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.23 
 
 
432 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3472  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.23 
 
 
432 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878016  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01389  cell cycle protein MesJ  36.51 
 
 
441 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.683525  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2319  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.41 
 
 
412 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.074868  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  31.34 
 
 
442 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.66 
 
 
468 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.15 
 
 
442 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.45 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.02 
 
 
472 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0581  ATP/GTP hydrolase  31.11 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.44 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  30.04 
 
 
343 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.45 
 
 
464 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.77 
 
 
481 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1673  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.19 
 
 
457 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0192  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.23 
 
 
432 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.85 
 
 
430 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.91 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.38 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.41 
 
 
375 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0190  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.72 
 
 
432 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  29.63 
 
 
332 aa  89.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  29.95 
 
 
326 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0257  tRNA(Ile)-lysidine synthase (tRNA(Ile)-lysidinesynthetase) (tRNA(Ile)-2-lysyl-cytidine synthase)  27.4 
 
 
318 aa  90.1  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.75 
 
 
476 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00186  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.72 
 
 
432 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00185  hypothetical protein  28.72 
 
 
432 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.434611  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0016  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  28.27 
 
 
422 aa  89.7  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  29.92 
 
 
476 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0541  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.04 
 
 
336 aa  89.4  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41194  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.23 
 
 
431 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0504  tRNA(Ile)-lysidine synthase  28.16 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0199  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.57 
 
 
432 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  29.08 
 
 
476 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.27 
 
 
442 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1834  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.11 
 
 
440 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.69 
 
 
455 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  28.8 
 
 
337 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  30.93 
 
 
354 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0978  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  29.41 
 
 
422 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0172584  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.62 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.39 
 
 
475 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.723741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.08 
 
 
476 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0589  cell cycle protein MesJ  34.85 
 
 
445 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0620316  normal  0.254248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>