More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0108 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0108  sodium/alanine symporter family protein  100 
 
 		 455 aa  907    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0386562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  33.11 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  33.56 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  33.33 
 
 		 455 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  33.11 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  33.11 
 
 		 455 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  33.11 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  33.11 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  32.88 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  33.26 
 
 		 455 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  32.88 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  34.91 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  32.52 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  31.49 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  31.64 
 
 		 459 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  32.16 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  30.97 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  32.36 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  32 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  29.96 
 
 		 447 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  30.13 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  31.4 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  31.4 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  31.18 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  31.18 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  32.43 
 
 		 468 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  31.23 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  30.51 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  30.26 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  31.35 
 
 		 459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  31.56 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  32.26 
 
 		 505 aa  182  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  30.04 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  30.74 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  28.78 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  31.18 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  30.5 
 
 		 448 aa  179  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  33.1 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  30.66 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  31.7 
 
 		 464 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  31.78 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  30.77 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  29.69 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  29.63 
 
 		 495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  32.61 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  32.19 
 
 		 498 aa  172  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  30.61 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  29.44 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  30.63 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0438  sodium:alanine symporter family protein  30.96 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.127152  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  29.02 
 
 		 456 aa  170  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  32.37 
 
 		 470 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  31.32 
 
 		 447 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  29.07 
 
 		 504 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0585  Sodium:alanine symporter  30.14 
 
 		 436 aa  169  7e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000000426502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  32.71 
 
 		 445 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  31.9 
 
 		 435 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  30.43 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  30.17 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  28.2 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1513  amino acid carrier protein  28.5 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000793212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  28.14 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  28.2 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  28.2 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  28.2 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  28.2 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  28.2 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  30.46 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  31.41 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  30.86 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  28.92 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  29.89 
 
 		 449 aa  167  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  30.79 
 
 		 452 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  29.22 
 
 		 497 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  29.22 
 
 		 497 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  30.91 
 
 		 464 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  28.6 
 
 		 503 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  30.14 
 
 		 458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  30.53 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  30.66 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  28.31 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  31.57 
 
 		 456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  29.61 
 
 		 456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  30.7 
 
 		 449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  31.55 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  30.8 
 
 		 453 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  30.49 
 
 		 450 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  30.72 
 
 		 452 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  31.41 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  29.95 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  30.68 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  29.9 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  30.68 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  30.68 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  30.68 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  30.04 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  30.25 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  28.27 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  29.63 
 
 		 457 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0330  sodium/alanine symporter family protein, putative  26.97 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>