18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0101 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0101  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2162  hypothetical protein  33.07 
 
 
280 aa  59.3  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00865051  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  26 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  30.23 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  30.23 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  22.67 
 
 
343 aa  48.5  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1015  hypothetical protein  26.17 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.62 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  26.39 
 
 
241 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  37.7 
 
 
274 aa  47  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  31.75 
 
 
239 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  26.39 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  25 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  28.95 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  23.03 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  24.83 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  22.83 
 
 
234 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>