More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12802 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12802  acyl-CoA dehydrogenase fadE21  100 
 
 		 410 aa  842    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2342  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.9 
 
 		 418 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  decreased coverage  0.00232541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.67 
 
 		 414 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.24 
 
 		 407 aa  544  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2977  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  65.94 
 
 		 412 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3021  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.94 
 
 		 412 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2992  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.18 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.0331169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3537  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.62 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.195685  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2499  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.18 
 
 		 407 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2337  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.07 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00222003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2622  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.55 
 
 		 431 aa  302  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.59 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.98 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.57 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  34.48 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  34.48 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.56 
 
 		 377 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  34.73 
 
 		 376 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  34.73 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.09 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.64 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.48 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  34.48 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  34.48 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  34.24 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.48 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2106  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.86 
 
 		 381 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.99 
 
 		 376 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.84 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.83 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  34.65 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.49 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.92 
 
 		 389 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  37.26 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.58 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.41 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  34.81 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0909  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.58 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0413  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.57 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.59 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.58 
 
 		 381 aa  193  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.58 
 
 		 380 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  32.84 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.02 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.83 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.23 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.630772  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1327  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.1 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34.72 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3002  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.25 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3527  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.33 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.41 
 
 		 392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.51 
 
 		 388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3396  acyl-CoA dehydrogenase  39.24 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.581792  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.68 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.64 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.59 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.25 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.01 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1226  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.57 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34 
 
 		 379 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.68 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.27 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.34 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4367  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.84 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1608  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.27 
 
 		 380 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.75 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0345355  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  31.77 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.17 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.08 
 
 		 379 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 		 384 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.25 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.98 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  34 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.19 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2056  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  34 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.66 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.83 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  34 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.95 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.53 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.27 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.83 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.83 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.51 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.68 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5062  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.92 
 
 		 387 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.17 
 
 		 392 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.25 
 
 		 390 aa  186  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  34.49 
 
 		 379 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.75 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.499178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>