More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12345 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12345  ornithine aminotransferase (N-terminus part) rocD1  100 
 
 
229 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  67.63 
 
 
403 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  65.89 
 
 
401 aa  279  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  65.85 
 
 
408 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  65.85 
 
 
408 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  65.85 
 
 
408 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  61.35 
 
 
680 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  55.45 
 
 
407 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  55.77 
 
 
399 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  60.1 
 
 
418 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  55.67 
 
 
424 aa  238  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  57.55 
 
 
427 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  57.29 
 
 
404 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  55.78 
 
 
404 aa  234  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  54.15 
 
 
416 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  52.91 
 
 
406 aa  223  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  54 
 
 
409 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  51.94 
 
 
413 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  49.07 
 
 
403 aa  215  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  52.97 
 
 
412 aa  215  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  51.16 
 
 
415 aa  214  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  52.34 
 
 
404 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  47.83 
 
 
403 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  49.06 
 
 
408 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  47.39 
 
 
402 aa  211  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  53.3 
 
 
396 aa  211  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  49.04 
 
 
399 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  45.93 
 
 
398 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  54.68 
 
 
407 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  46.01 
 
 
399 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  44.05 
 
 
410 aa  201  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  46.12 
 
 
402 aa  201  9e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  48.08 
 
 
399 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  52.24 
 
 
406 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  46.15 
 
 
396 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  46.15 
 
 
396 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  45.02 
 
 
415 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  48.53 
 
 
411 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  46.12 
 
 
396 aa  191  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  44.98 
 
 
396 aa  191  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  47.91 
 
 
404 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  47 
 
 
412 aa  190  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  43.93 
 
 
414 aa  190  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  45.67 
 
 
408 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  45.19 
 
 
408 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  48.73 
 
 
415 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  40.09 
 
 
417 aa  185  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  40.83 
 
 
409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  43 
 
 
409 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  44.76 
 
 
408 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  41.31 
 
 
398 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  39.44 
 
 
425 aa  182  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  44.29 
 
 
422 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  44.85 
 
 
410 aa  178  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  40.47 
 
 
448 aa  174  9e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  42.67 
 
 
454 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  39.73 
 
 
410 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  42.73 
 
 
435 aa  165  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  43.35 
 
 
405 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  38.39 
 
 
452 aa  161  8.000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  36.23 
 
 
394 aa  158  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  36.23 
 
 
394 aa  158  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  37.98 
 
 
420 aa  155  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  37.96 
 
 
417 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.65 
 
 
417 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  34.31 
 
 
397 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  34.83 
 
 
396 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  35.6 
 
 
391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  33.33 
 
 
397 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.1 
 
 
395 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  33.68 
 
 
388 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  31.34 
 
 
403 aa  112  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  33.51 
 
 
411 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  35 
 
 
391 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  36.73 
 
 
394 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  36.22 
 
 
390 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  32.83 
 
 
396 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  30.54 
 
 
395 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  30.48 
 
 
396 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.66 
 
 
393 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  34.31 
 
 
396 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  33.66 
 
 
387 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  33.17 
 
 
395 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  31.36 
 
 
411 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  32.52 
 
 
399 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  33.33 
 
 
392 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  33.33 
 
 
398 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.29 
 
 
396 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  31.12 
 
 
400 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.66 
 
 
397 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>