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for query gene TBFG_11905 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.52 
 
 
682 aa  765    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  100 
 
 
687 aa  1344    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.38 
 
 
682 aa  763    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.12 
 
 
650 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.38 
 
 
682 aa  763    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.57 
 
 
685 aa  740    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.41 
 
 
678 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.54 
 
 
685 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.42 
 
 
697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.29 
 
 
680 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.88 
 
 
666 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.58 
 
 
672 aa  410  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  40.51 
 
 
666 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.1 
 
 
539 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.47 
 
 
676 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.54 
 
 
558 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.02 
 
 
554 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.53 
 
 
513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.71 
 
 
520 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.22 
 
 
528 aa  353  8.999999999999999e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.39 
 
 
569 aa  350  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.92 
 
 
504 aa  349  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.71 
 
 
509 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.36 
 
 
504 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.36 
 
 
504 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.36 
 
 
504 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.33 
 
 
509 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.36 
 
 
504 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.36 
 
 
504 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.9 
 
 
504 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.14 
 
 
519 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.33 
 
 
504 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.52 
 
 
522 aa  346  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.47 
 
 
504 aa  344  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.02 
 
 
504 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.68 
 
 
509 aa  344  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.68 
 
 
509 aa  344  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.88 
 
 
530 aa  343  7e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.49 
 
 
505 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.63 
 
 
504 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.76 
 
 
525 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.35 
 
 
501 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.33 
 
 
567 aa  339  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.04 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 
538 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 
528 aa  336  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.76 
 
 
504 aa  334  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.84 
 
 
514 aa  329  8e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.11 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.03 
 
 
523 aa  321  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.71 
 
 
526 aa  320  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.48 
 
 
575 aa  319  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.18 
 
 
535 aa  319  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.09 
 
 
592 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.79 
 
 
557 aa  317  5e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.22 
 
 
525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 
565 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.33 
 
 
532 aa  306  8.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.87 
 
 
572 aa  306  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.37 
 
 
524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.46 
 
 
535 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.8 
 
 
528 aa  300  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 
537 aa  297  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 
537 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  34.01 
 
 
537 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  33.89 
 
 
537 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 
555 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  34.08 
 
 
537 aa  295  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.56 
 
 
539 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 
523 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  34.42 
 
 
537 aa  290  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  34.42 
 
 
537 aa  290  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  34.42 
 
 
537 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 
516 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.86 
 
 
554 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 
538 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.16 
 
 
519 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.91 
 
 
541 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.88 
 
 
522 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.68 
 
 
641 aa  280  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.15 
 
 
524 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  40.39 
 
 
537 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.7 
 
 
538 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
491 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.21 
 
 
593 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.08 
 
 
534 aa  273  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  35.32 
 
 
476 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 
575 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 
538 aa  269  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 
561 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.85 
 
 
566 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.19 
 
 
702 aa  267  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  35.38 
 
 
535 aa  267  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal 
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.83 
 
 
621 aa  267  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.48 
 
 
685 aa  266  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
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NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.99 
 
 
684 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_33640  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 
575 aa  265  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179116  normal 
 
 
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NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.21 
 
 
615 aa  261  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
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NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 
584 aa  259  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal 
 
 
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NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.41 
 
 
624 aa  259  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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