64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2120 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2120  ribonuclease III  100 
 
 		 138 aa  270  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1940  ribonuclease III  60.94 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.695553  normal  0.347007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2312  ribonuclease III  58.62 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.918616  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2284  ribonuclease III  61.34 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.445322  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4412  ribonuclease III  57.85 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3194  ribonuclease III  61.61 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3685  ribonuclease III  55.83 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2425  ribonuclease III  55.83 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1305  hypothetical protein  52.54 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15791  hypothetical protein  48.76 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1154  hypothetical protein  51.33 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.784455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09301  hypothetical protein  45.05 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0249476 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0261  hypothetical protein  45.05 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2061  hypothetical protein  42.97 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0850  hypothetical protein  42.59 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2354  hypothetical protein  46.22 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34376  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09091  hypothetical protein  41.51 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09111  hypothetical protein  41.51 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.812388  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10321  hypothetical protein  37.7 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.730053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3321  ribonuclease III  38.1 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000186185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0087  ribonuclease III  43.12 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0266  ribonuclease III  43.2 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000768224  normal  0.0115191 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13944  predicted protein  41.38 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0172  ribonuclease III  46.43 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000401793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06951  hypothetical protein  44.8 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.056315  normal  0.0999203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5215  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527378  unclonable  5.1229600000000003e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0085  hypothetical protein  39.83 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000804774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0121  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000631862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0111  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0092222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0090  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0851782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0101  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0086  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0090  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000630531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0087  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0090  hypothetical protein  40.52 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0085  ribonuclease III  40.52 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.46597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0399  ribonuclease III  42 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2483  ribonuclease III  46.43 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000130783  normal  0.0178279 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2736  hypothetical protein  36.07 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2422  hypothetical protein  36.07 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35651  predicted protein  40 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0106651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3323  ribonuclease III  35.58 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545718  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0171  hypothetical protein  37.82 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.241857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0091  ribonuclease III  39.45 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000109584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0567  hypothetical protein  34.75 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0553  hypothetical protein  34.75 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2049  ribonuclease III  36.84 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000924659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0700  ribonuclease III  33.64 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0118  hypothetical protein  36.28 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0054  ribonuclease III  36.28 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0917731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00970  ribonuclease III  39.47 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2731  ribonuclease III  41.58 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0194  ribonuclease III  46.46 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0847  hypothetical protein  43.04 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0208  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1823  ribonuclease III family protein  33.96 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0304  ribonuclease III  34.71 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000121924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1035  ribonuclease III  34.78 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1085  ribonuclease III  34.78 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1426  ribonuclease III family protein  31.71 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000290705  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0339  hypothetical protein  33.63 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203388  hitchhiker  0.000000343763 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2042  ribonuclease III family protein  31.15 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0597  hypothetical protein  23.48 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92118  predicted protein  28.46 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>