More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1971 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1971  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
252 aa  499  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  76.95 
 
 
395 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  75.72 
 
 
398 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  75.72 
 
 
398 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  74.9 
 
 
400 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  74.49 
 
 
392 aa  371  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  73.25 
 
 
395 aa  370  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  73.66 
 
 
396 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  60 
 
 
393 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  63.2 
 
 
392 aa  282  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  62.29 
 
 
393 aa  278  7e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  55.42 
 
 
394 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  54.77 
 
 
394 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  58.44 
 
 
398 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  54.51 
 
 
386 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  52.36 
 
 
394 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  49.59 
 
 
392 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  50 
 
 
394 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  45.08 
 
 
390 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  45.08 
 
 
391 aa  218  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  47.33 
 
 
391 aa  214  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  49.39 
 
 
396 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  44.22 
 
 
413 aa  211  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  41.43 
 
 
415 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  48.91 
 
 
393 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  44.08 
 
 
400 aa  208  5e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  42.62 
 
 
405 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  45.96 
 
 
392 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  48.16 
 
 
394 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  43.8 
 
 
401 aa  203  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  44.81 
 
 
399 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  42.39 
 
 
405 aa  201  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  43.98 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  42.49 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  44.58 
 
 
387 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  46.75 
 
 
399 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  43.03 
 
 
394 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  43.98 
 
 
389 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  42.74 
 
 
397 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  41.43 
 
 
403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  44.53 
 
 
408 aa  195  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  43.62 
 
 
395 aa  194  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  44.13 
 
 
387 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  42.98 
 
 
394 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.43 
 
 
393 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  44.18 
 
 
410 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  47.77 
 
 
400 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  41.04 
 
 
403 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  42.28 
 
 
405 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39.83 
 
 
379 aa  192  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  46.72 
 
 
389 aa  191  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  39.92 
 
 
389 aa  191  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  45.71 
 
 
396 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  44.22 
 
 
396 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  42.91 
 
 
387 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  41.77 
 
 
387 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  44.76 
 
 
391 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  44.05 
 
 
390 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  44.31 
 
 
402 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  42.74 
 
 
398 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  44.44 
 
 
389 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  40 
 
 
405 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  44.21 
 
 
373 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  39.84 
 
 
400 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  42.62 
 
 
403 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0093  amidohydrolase  42.42 
 
 
392 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0090  amidohydrolase  42.42 
 
 
392 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  41.18 
 
 
391 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  41.18 
 
 
391 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  43.82 
 
 
395 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  42.37 
 
 
398 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  46.64 
 
 
458 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  44.63 
 
 
382 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  43.55 
 
 
400 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  42.19 
 
 
396 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.17 
 
 
386 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.64 
 
 
388 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  41.98 
 
 
407 aa  186  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  45.69 
 
 
384 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  46.55 
 
 
395 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.09 
 
 
379 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  41.77 
 
 
409 aa  185  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  36.21 
 
 
393 aa  185  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  42.34 
 
 
404 aa  184  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  45.65 
 
 
388 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  42.42 
 
 
459 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  44.26 
 
 
387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  41.22 
 
 
399 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  43.4 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  49.8 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  44.9 
 
 
385 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  43.11 
 
 
386 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1523  M20/M25/M40 family peptidase  42.31 
 
 
404 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000131931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  45.49 
 
 
388 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.88 
 
 
391 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  45.08 
 
 
385 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  44.9 
 
 
385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1023  amidohydrolase  41.42 
 
 
388 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00286285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  40.66 
 
 
398 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  40 
 
 
400 aa  182  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>