18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1196 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1196  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  156  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138006  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3889  hypothetical protein  57.89 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3839  hypothetical protein  57.89 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0232  hypothetical protein  52.7 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0486  hypothetical protein  52.86 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4497  hypothetical protein  51.43 
 
 
89 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2896  hypothetical protein  46.67 
 
 
93 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0228295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0974  hypothetical protein  46.97 
 
 
74 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0886167  normal  0.272279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1213  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10191  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230753  normal  0.122278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1256  hypothetical protein  43.59 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08401  hypothetical protein  44.93 
 
 
78 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08051  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00183812  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08041  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.354804  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16551  hypothetical protein  55.74 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.700832 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07801  hypothetical protein  44.78 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.288735  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0148  hypothetical protein  44.78 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0752  hypothetical protein  44.93 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>