23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0614 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0614  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1108    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.885937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0877  hypothetical protein  37 
 
 
561 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0903  hypothetical protein  36.82 
 
 
569 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1390  hypothetical protein  36.19 
 
 
562 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.946719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5121  hypothetical protein  37.41 
 
 
569 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00799085  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1131  hypothetical protein  33.69 
 
 
558 aa  296  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1663  hypothetical protein  35.2 
 
 
551 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0778534  normal  0.136849 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2415  hypothetical protein  29.38 
 
 
538 aa  137  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26941  hypothetical protein  29.62 
 
 
537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2095  hypothetical protein  27.59 
 
 
538 aa  109  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01791  hypothetical protein  25.31 
 
 
534 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.806064  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3787  hypothetical protein  21.14 
 
 
556 aa  79.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3609  hypothetical protein  25.75 
 
 
539 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0595  hypothetical protein  21.62 
 
 
555 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0630  hypothetical protein  21.61 
 
 
543 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3687  hypothetical protein  22.15 
 
 
583 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0345  hypothetical protein  20.51 
 
 
536 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.964899  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0514  hypothetical protein  21.49 
 
 
570 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0049  hypothetical protein  22.14 
 
 
566 aa  58.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3131  hypothetical protein  23.58 
 
 
564 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1529  hypothetical protein  18.97 
 
 
528 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0407256  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02361  hypothetical protein  18.79 
 
 
528 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3575  squalene/oxidosqualene cyclase  34.88 
 
 
668 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.224012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>