17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2152 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2152  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  520  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2467  hypothetical protein  54.33 
 
 
242 aa  263  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27821  hypothetical protein  54.5 
 
 
245 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0630  hypothetical protein  36.71 
 
 
380 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.313978  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4065  S-layer domain protein  37.87 
 
 
416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4104  S-layer domain protein  37.87 
 
 
416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0411  hypothetical protein  38.04 
 
 
196 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0039  hypothetical protein  34.1 
 
 
389 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2272  hypothetical protein  37.89 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1947  Sporulation domain protein  36.42 
 
 
362 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1974  Sporulation domain protein  36.42 
 
 
362 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.160258  normal  0.0302087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4842  hypothetical protein  34.33 
 
 
287 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03111  hypothetical protein  35.38 
 
 
247 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1338  hypothetical protein  37.93 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193609  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  33.33 
 
 
412 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2943  hypothetical protein  34.62 
 
 
191 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2520  hypothetical protein  29.48 
 
 
585 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>