22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1947 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1947  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0383  hypothetical protein  84.15 
 
 
82 aa  143  9e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.578022  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22961  hypothetical protein  65 
 
 
79 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1655  hypothetical protein  55 
 
 
81 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17541  hypothetical protein  58.02 
 
 
81 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00180433  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17701  hypothetical protein  56.79 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20081  hypothetical protein  56.79 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16821  hypothetical protein  51.85 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1134  hypothetical protein  55.56 
 
 
79 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17501  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.106076  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0658  hypothetical protein  47.5 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0639  hypothetical protein  46.25 
 
 
71 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.325509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3144  hypothetical protein  45.57 
 
 
71 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.317008  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2698  hypothetical protein  43.04 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4910  hypothetical protein  46.15 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0653  hypothetical protein  46.84 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00361702  normal  0.140035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0634  hypothetical protein  45.57 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0942  hypothetical protein  46.84 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231298  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12861  hypothetical protein  40.32 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.278738  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1215  hypothetical protein  38.71 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00621339  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15761  hypothetical protein  37.1 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188926  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12791  hypothetical protein  40.32 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00229985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>