More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1637 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1637  RNA binding S1  100 
 
 
412 aa  828    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397933  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0726  SSU ribosomal protein S1P  86.02 
 
 
424 aa  687    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07751  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  72.96 
 
 
481 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05331  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  62.5 
 
 
416 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.422935  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  60.24 
 
 
465 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1861  SSU ribosomal protein S1P  61 
 
 
431 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0931144  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05941  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  54.16 
 
 
408 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0530  SSU ribosomal protein S1P  52.88 
 
 
404 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05561  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  53.33 
 
 
401 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.748166  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  53.85 
 
 
401 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.974619  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1591  RNA binding S1  45.73 
 
 
295 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.762694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.55 
 
 
301 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  42.62 
 
 
302 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  42.62 
 
 
302 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  41.26 
 
 
302 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000110633  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  44.94 
 
 
304 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  39.15 
 
 
284 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3643  RNA binding S1 domain protein  39.31 
 
 
292 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  37.2 
 
 
367 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  38.25 
 
 
331 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  38.25 
 
 
331 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  37.72 
 
 
343 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0468  30S ribosomal protein S1  38.19 
 
 
386 aa  203  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.02 
 
 
341 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1867  30S ribosomal protein S1  37.24 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.61448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  36.84 
 
 
328 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  37.32 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04021  30S ribosomal protein S1  36.42 
 
 
369 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  36.56 
 
 
390 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03371  30S ribosomal protein S1  37.18 
 
 
363 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03361  30S ribosomal protein S1  37.18 
 
 
363 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1689  30S ribosomal protein S1  38.16 
 
 
369 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03471  30S ribosomal protein S1  36.81 
 
 
371 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0318  30S ribosomal protein S1  37.37 
 
 
366 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.721162  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0694  30S ribosomal protein S1  38.06 
 
 
307 aa  190  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000685189  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03451  30S ribosomal protein S1  36.54 
 
 
363 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10847  predicted protein  36.07 
 
 
284 aa  186  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695244  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36339  Plastid ribosomal protein S1, imported to chloroplast, small ribosomal subunit  35.79 
 
 
339 aa  177  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  30.55 
 
 
686 aa  136  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.18 
 
 
687 aa  133  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  29.79 
 
 
587 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.15 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.63 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.68 
 
 
411 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.63 
 
 
388 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  29.85 
 
 
490 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  29.48 
 
 
485 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  29.48 
 
 
496 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  29.48 
 
 
480 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  29.46 
 
 
495 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  29.46 
 
 
400 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.95 
 
 
415 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  28.68 
 
 
487 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.08 
 
 
736 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  28.3 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  28.68 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  29.47 
 
 
397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  28.3 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  28.3 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  28.84 
 
 
487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  28.3 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  28.3 
 
 
481 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  28.3 
 
 
481 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  28.95 
 
 
495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  31.01 
 
 
598 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  29.15 
 
 
488 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  28.3 
 
 
485 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  29.18 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  28.46 
 
 
586 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  29.89 
 
 
678 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  27.61 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0644  30S ribosomal protein S1  29.92 
 
 
611 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.35055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  29.18 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.27 
 
 
672 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  28.77 
 
 
720 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  29.32 
 
 
599 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  28.52 
 
 
492 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  28.78 
 
 
529 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  29.62 
 
 
488 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.28 
 
 
694 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  28.89 
 
 
496 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  29.46 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  28.36 
 
 
500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  29.57 
 
 
672 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  27.72 
 
 
515 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  31.52 
 
 
378 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  27.92 
 
 
488 aa  116  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  27.24 
 
 
644 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  33.33 
 
 
604 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  28.3 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  28.73 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  32.17 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  28.84 
 
 
505 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  30.45 
 
 
493 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  30.45 
 
 
493 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  28.08 
 
 
595 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  26.87 
 
 
500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.27 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  27.88 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  30.74 
 
 
507 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>