More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0071 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0071  aspartate kinase  100 
 
 
64 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0068  aspartate kinase  98.21 
 
 
601 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0071  aspartate kinase  89.29 
 
 
601 aa  98.6  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1246  aspartate kinase  79.63 
 
 
588 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0595781  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00821  aspartate kinase  75.93 
 
 
595 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0385896 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17741  aspartate kinase  75.93 
 
 
588 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21161  aspartate kinase  77.78 
 
 
588 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.926226  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  78.85 
 
 
411 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  74.07 
 
 
599 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1001  aspartate kinase  75 
 
 
616 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  66.67 
 
 
411 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1711  aspartate kinase  70.37 
 
 
406 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  68.52 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  66.67 
 
 
424 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  68.52 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0226  aspartate kinase  70.37 
 
 
421 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0265  aspartate kinase  70.37 
 
 
421 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.472998  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3642  aspartate kinase  70.37 
 
 
604 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  66.67 
 
 
407 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18381  aspartate kinase  62.96 
 
 
586 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  62.96 
 
 
413 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  66.67 
 
 
421 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2221  aspartate kinase  68.52 
 
 
599 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  60.32 
 
 
421 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  66.67 
 
 
407 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  64.29 
 
 
427 aa  72  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  62.96 
 
 
411 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  62.96 
 
 
411 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  68.52 
 
 
601 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  66.67 
 
 
421 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  64.81 
 
 
421 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  61.11 
 
 
411 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  64.81 
 
 
424 aa  71.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0976  aspartate kinase  66.67 
 
 
408 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  64.81 
 
 
410 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  64.81 
 
 
410 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1175  aspartate kinase  74.07 
 
 
599 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  62.96 
 
 
411 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1740  aspartate kinase  61.11 
 
 
586 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  66.67 
 
 
412 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  57.14 
 
 
421 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  57.14 
 
 
421 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  57.14 
 
 
421 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  66.07 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  66.07 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  66.67 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  64.81 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  64.81 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  62.96 
 
 
405 aa  68.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  62.96 
 
 
405 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  61.11 
 
 
413 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  64.81 
 
 
435 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0262  aspartate kinase  66.67 
 
 
422 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  58.62 
 
 
405 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  58.62 
 
 
404 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  62.96 
 
 
405 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  61.11 
 
 
406 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  64.81 
 
 
422 aa  68.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  60.34 
 
 
421 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  56.9 
 
 
405 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  62.96 
 
 
434 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  56.9 
 
 
405 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  64.81 
 
 
421 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  61.67 
 
 
411 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  58.62 
 
 
407 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  64.81 
 
 
416 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  65.38 
 
 
408 aa  68.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  68.52 
 
 
408 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  68.52 
 
 
408 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  68 
 
 
422 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6573  aspartate kinase  64.81 
 
 
422 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  61.11 
 
 
408 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  62.96 
 
 
426 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  59.26 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1883  aspartate kinase  64.29 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1821  aspartate kinase  64.29 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.529675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1676  aspartate kinase  64.29 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  62.5 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3521  aspartate kinase  64.29 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1811  aspartate kinase  64.29 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  61.11 
 
 
440 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18571  aspartate kinase  57.41 
 
 
586 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137718  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18381  aspartate kinase  59.26 
 
 
586 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0074  aspartate kinase  60.38 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  64.29 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1857  aspartate kinase  64.29 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.974180000000001e-30 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  61.11 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  61.11 
 
 
421 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  64.81 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3729  aspartate kinase  57.41 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3655  aspartate kinase  57.41 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  60.38 
 
 
427 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3589  aspartate kinase  57.41 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3519  aspartate kinase  58.62 
 
 
405 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  57.41 
 
 
410 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  62.5 
 
 
409 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  59.26 
 
 
428 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  61.11 
 
 
409 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  59.26 
 
 
428 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  59.26 
 
 
404 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>