17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2272 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2272  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0411  hypothetical protein  78.69 
 
 
196 aa  298  5e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03111  hypothetical protein  64.8 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1338  hypothetical protein  44.77 
 
 
260 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193609  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2943  hypothetical protein  39.33 
 
 
191 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4842  hypothetical protein  37.78 
 
 
287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  35.96 
 
 
412 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0039  hypothetical protein  35.36 
 
 
389 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1947  Sporulation domain protein  35.5 
 
 
362 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1974  Sporulation domain protein  35.5 
 
 
362 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.160258  normal  0.0302087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4104  S-layer domain protein  37.27 
 
 
416 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4065  S-layer domain protein  37.27 
 
 
416 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2467  hypothetical protein  38.42 
 
 
242 aa  115  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0630  hypothetical protein  35.78 
 
 
380 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.313978  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2152  hypothetical protein  38.55 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2520  hypothetical protein  29.41 
 
 
585 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27821  hypothetical protein  32.8 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>