17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1777 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1777  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  259  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.152459  normal  0.0700483 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0868  hypothetical protein  85.5 
 
 
131 aa  226  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13381  hypothetical protein  62.07 
 
 
159 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1517  hypothetical protein  56.39 
 
 
147 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0204611  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03721  hypothetical protein  57.81 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19001  hypothetical protein  54.69 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1030  hypothetical protein  54.69 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06481  hypothetical protein  51.54 
 
 
136 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06781  hypothetical protein  51.15 
 
 
137 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0622  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06871  hypothetical protein  49.61 
 
 
133 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0349  hypothetical protein  52.27 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1141  hypothetical protein  49.41 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1171  hypothetical protein  49.41 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14151  hypothetical protein  63.93 
 
 
85 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12471  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.183181  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13371  hypothetical protein  40.48 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.721942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>