44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1765 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  55.14 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  35.33 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  35.33 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15191  hypothetical protein  34.38 
 
 		 183 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  32.43 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  32.97 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  31.38 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0070  hypothetical protein  36.17 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.5 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  34.52 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.2 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.04 
 
 		 193 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.14 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.14 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.67 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41681  predicted protein  28.51 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47090  predicted protein  27.7 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.21 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.88 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43552  predicted protein  27.52 
 
 		 282 aa  50.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0745  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.52 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01800  hypothetical protein  27 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853891  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1782  pyridoxamine-phosphate oxidase  28.65 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.5 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.21 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.17 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.46 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1026  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.48 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.392091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.17 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.93 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.18 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.22 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.44 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.780711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.95 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.932005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.24 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.65 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.48 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.78 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00869837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.5 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.97 
 
 		 198 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24050  pyridoxamine-phosphate oxidase  32.93 
 
 		 250 aa  41.6  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.66 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>