12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0668 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0668  serine/threonine specific protein phosphatase  100 
 
 
323 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.370216  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13481  Serine/threonine specific protein phosphatase  48.29 
 
 
350 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4350  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
371 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5058  metallophosphoesterase  43.79 
 
 
386 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3294  metallophosphoesterase  40.94 
 
 
377 aa  243  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4300  metallophosphoesterase  41.98 
 
 
365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4358  metallophosphoesterase  41.64 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14426  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0765  metallophosphoesterase  35.37 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  22.97 
 
 
300 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5406  metallophosphoesterase  28.08 
 
 
615 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1623  hypothetical protein  28.71 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>