22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0554 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0554  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1090    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.169358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0227  putative GAF sensor protein  27.78 
 
 
425 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4186  sulfotransferase  27.04 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal  0.326163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0085  sulfotransferase  23.55 
 
 
287 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
371 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2217  Alcohol sulfotransferase  23.57 
 
 
287 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.116061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2155  Alcohol sulfotransferase  23.57 
 
 
272 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1291  sulfotransferase  23.32 
 
 
290 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
602 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
545 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2745  sulfotransferase  28.23 
 
 
314 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486823  hitchhiker  0.00314682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0907  putative PAS/PAC sensor protein  27.03 
 
 
535 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
1017 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0484  sulfotransferase  27.72 
 
 
314 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1549  sulfotransferase  28.32 
 
 
258 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1283  sulfotransferase  29.91 
 
 
293 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
1211 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  22.79 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0517  sulfotransferase  31.48 
 
 
274 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  26.09 
 
 
368 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  21.28 
 
 
859 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  24.81 
 
 
711 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>