More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0057 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0057  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 115 aa  221  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0054  50S ribosomal protein L20  93.91 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.604551  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21311  50S ribosomal protein L20  89.57 
 
 		 115 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.105631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1260  50S ribosomal protein L20  89.57 
 
 		 115 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00591  50S ribosomal protein L20  89.57 
 
 		 115 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17881  50S ribosomal protein L20  85.09 
 
 		 115 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0873829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1277  50S ribosomal protein L20  82.73 
 
 		 116 aa  154  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18711  50S ribosomal protein L20  75.89 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18521  50S ribosomal protein L20  77.68 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3448  50S ribosomal protein L20  75.22 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1478  50S ribosomal protein L20  77.88 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.910171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4309  50S ribosomal protein L20  73.91 
 
 		 118 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1754  50S ribosomal protein L20  74.11 
 
 		 115 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18521  50S ribosomal protein L20  72.17 
 
 		 115 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.331262  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2606  50S ribosomal protein L20  73.45 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4255  50S ribosomal protein L20  73.45 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  66.09 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  65.77 
 
 		 116 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3500  50S ribosomal protein L20  73.45 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.193711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 119 aa  140  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 117 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  59.65 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 117 aa  133  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  63.73 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  61.32 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  61.32 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1882  50S ribosomal protein L20  67.26 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0641503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2031  50S ribosomal protein L20P  61 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000296283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  53.04 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  55.36 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>