More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0018 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0018  Type II secretory pathway component PulF-like  100 
 
 
215 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00171  pili biogenesis protein  85.07 
 
 
426 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  56.52 
 
 
406 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  61.19 
 
 
410 aa  160  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  54.89 
 
 
407 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  57.89 
 
 
407 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  54.14 
 
 
404 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  54.14 
 
 
404 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  51.91 
 
 
404 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  49.24 
 
 
409 aa  138  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  49.02 
 
 
377 aa  134  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  46.97 
 
 
409 aa  128  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  38.99 
 
 
409 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  45.11 
 
 
401 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  45.07 
 
 
417 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  45.07 
 
 
417 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  43.28 
 
 
419 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  45.07 
 
 
417 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  44.78 
 
 
410 aa  122  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  45.04 
 
 
417 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  52.24 
 
 
403 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  50.41 
 
 
417 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  42.68 
 
 
405 aa  121  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  47.33 
 
 
406 aa  121  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  42.24 
 
 
405 aa  121  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06891  Type II secretory pathway component PulF-like protein  45.86 
 
 
453 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  42.11 
 
 
411 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  42.18 
 
 
404 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  44.88 
 
 
406 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  44.88 
 
 
407 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  45.11 
 
 
405 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  43.15 
 
 
406 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  42.64 
 
 
401 aa  118  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  37.82 
 
 
401 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  44.09 
 
 
405 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  42.22 
 
 
405 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  42.19 
 
 
404 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  40.96 
 
 
406 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  40.31 
 
 
403 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  44.88 
 
 
412 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  44.36 
 
 
422 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08221  Type II secretory pathway, component PulF  41.72 
 
 
385 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.373035  hitchhiker  0.0000586534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  37.42 
 
 
416 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  42.64 
 
 
419 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  45.67 
 
 
403 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  45.67 
 
 
402 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  39.53 
 
 
405 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  44.88 
 
 
405 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  40.82 
 
 
408 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  39.87 
 
 
403 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  37.58 
 
 
403 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  42.52 
 
 
404 aa  108  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  41.61 
 
 
407 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  39.46 
 
 
402 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  44.09 
 
 
401 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  41.73 
 
 
419 aa  108  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  36.31 
 
 
403 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  42.31 
 
 
408 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  40.46 
 
 
401 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  43.31 
 
 
423 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  45.67 
 
 
419 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  45.67 
 
 
419 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  42.52 
 
 
420 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  40.94 
 
 
417 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  39.06 
 
 
403 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  41.73 
 
 
405 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1187  Type II secretory pathway component PulF-like  47.37 
 
 
446 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.497537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  42.52 
 
 
422 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  37.98 
 
 
402 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  39.33 
 
 
409 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  41.54 
 
 
406 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  38.78 
 
 
405 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  40.94 
 
 
422 aa  104  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  39.55 
 
 
402 aa  104  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  42.52 
 
 
423 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  41.73 
 
 
421 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  42.52 
 
 
408 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  42.52 
 
 
422 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  42.52 
 
 
423 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  42.52 
 
 
423 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  42.52 
 
 
423 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  39.46 
 
 
405 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  37.01 
 
 
402 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  44.09 
 
 
421 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  41.73 
 
 
421 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  37.01 
 
 
402 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  40.94 
 
 
419 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  39.86 
 
 
407 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  42.52 
 
 
420 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  41.73 
 
 
421 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  42.52 
 
 
424 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  43.31 
 
 
424 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  38.78 
 
 
408 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  34.35 
 
 
403 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  40.94 
 
 
421 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  40.94 
 
 
421 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  38.78 
 
 
405 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  37.8 
 
 
401 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  37.23 
 
 
409 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  40.94 
 
 
419 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>