125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4721 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4721  fatty acid desaturase  100 
 
 
321 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2228  fatty acid desaturase  47.97 
 
 
346 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189769  normal  0.0932296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0141  fatty acid desaturase  46.96 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0732  fatty acid desaturase  45.33 
 
 
308 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0710  fatty acid desaturase  44.37 
 
 
316 aa  291  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0069  fatty acid desaturase  46.28 
 
 
320 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0719  fatty acid desaturase  45.42 
 
 
308 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0711  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  44.01 
 
 
301 aa  259  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51664  predicted protein  31.72 
 
 
358 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00562314  decreased coverage  0.000590546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3554  stearoyl-CoA 9-desaturase  33.33 
 
 
272 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.463733  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5567  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.2 
 
 
280 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.972132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4595  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.57 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1437  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.18 
 
 
270 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4812  Stearoyl-CoA 9-desaturase  31.1 
 
 
272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2396  Stearoyl-CoA 9-desaturase  30.94 
 
 
282 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3349  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.69 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2277  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.12 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.134636  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0662  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.81 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1271  Fatty acid desaturase, type 1  30.57 
 
 
309 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21421  Fatty acid desaturase, type 1  30.57 
 
 
259 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.661298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0640  Stearoyl-CoA 9-desaturase  32.42 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18621  Fatty acid desaturase, type 1  30.37 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2192  stearoyl-CoA 9-desaturase  30.71 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1764  Fatty acid desaturase, type 1  30.37 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17991  Fatty acid desaturase, type 1  31 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18811  Fatty acid desaturase, type 1  30 
 
 
312 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.52562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18621  Fatty acid desaturase, type 1  28.62 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.702391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4212  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  32.33 
 
 
272 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2561  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  30.19 
 
 
278 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.701593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4171  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  29.45 
 
 
294 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2541  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.3 
 
 
303 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2191  stearoyl-CoA 9-desaturase  27.47 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28931  Fatty acid desaturase, type 1  26.57 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28951  Fatty acid desaturase, type 1  28.73 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4777  Stearoyl-CoA 9-desaturase  29.29 
 
 
284 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2221  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.87 
 
 
287 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.309276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2131  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.53 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1717  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  27.65 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3820  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.55 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2257  Stearoyl-CoA 9-desaturase  27.42 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33198  hitchhiker  0.000000591584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2880  Stearoyl-CoA 9-desaturase  26.61 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.145376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2085  stearoyl-CoA 9-desaturase  29.07 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6429  Stearoyl-CoA 9-desaturase  28 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1907  stearoyl-CoA 9-desaturase  24.58 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2875  fatty acid desaturase  25.3 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01780  delta 9 acyl-lipid fatty acid desaturase  24.08 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1607  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  24.7 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4186  Stearoyl-CoA 9-desaturase  24.9 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32330  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  23.08 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5328  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  24.63 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.513576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1957  Stearoyl-CoA 9-desaturase  21.52 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0747957 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1156  JamB  22.68 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2938  fatty acid desaturase family protein  22.68 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2784  fatty acid desaturase family protein  22.68 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4990  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25.1 
 
 
307 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3182  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
404 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16070  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  22.58 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0281  JamB  22.3 
 
 
344 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0742  fatty acid desaturase  35.65 
 
 
407 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2738  Fatty acid desaturase  25.29 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0167  Stearoyl-CoA 9-desaturase  21.3 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1736  fatty acid desaturase  27.59 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.156317  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1267  stearoyl-CoA 9-desaturase  24.11 
 
 
396 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000517428  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4336  fatty acid desaturase  30.21 
 
 
251 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  hitchhiker  0.00142365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8743  Stearoyl-CoA 9-desaturase  22.71 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2615  Stearoyl-CoA 9-desaturase  25.55 
 
 
311 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1959  Stearoyl-CoA 9-desaturase  22.91 
 
 
323 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000202023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0932  Stearoyl-CoA 9-desaturase  21.32 
 
 
331 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3804  fatty acid desaturase  29.6 
 
 
399 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5325  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  18.96 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627772  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3386  fatty acid desaturase  31.78 
 
 
403 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1280  fatty acid desaturase  30.16 
 
 
404 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0771  stearoyl-CoA 9-desaturase  23.43 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2724  fatty acid desaturase  31.78 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0290256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0319  hypothetical protein  31.15 
 
 
384 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0660  Stearoyl-CoA 9-desaturase  20.54 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0303  hypothetical protein  31.15 
 
 
384 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1482  stearoyl-CoA 9-desaturase  20.49 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2875  fatty acid desaturase  24.4 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.9509  normal  0.838221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3312  Stearoyl-CoA 9-desaturase  19.54 
 
 
308 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5369  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
407 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.479169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2261  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  22.75 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0125553  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3216  fatty acid desaturase  30.6 
 
 
399 aa  49.3  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0191  Fatty acid desaturase  23.41 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1454  fatty acid desaturase  25.9 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.843148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0087  Fatty acid desaturase  26.32 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1354  fatty acid desaturase  23.51 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149217  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48940  Fatty acid desaturase  37.23 
 
 
407 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0305  fatty acid desaturase  23.98 
 
 
412 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3960  stearoyl-CoA 9-desaturase  22.66 
 
 
377 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0636578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3564  fatty acid desaturase  24.67 
 
 
249 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392803  normal  0.531214 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0168  hypothetical protein  44.07 
 
 
395 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1115  putative stearoyl-CoA desaturase oxidoreductase protein  24.69 
 
 
407 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3156  Stearoyl-CoA 9-desaturase  23.08 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2328  fatty acid desaturase  30.82 
 
 
396 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422695  normal  0.150033 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1153  acyl-CoA desaturase  23.28 
 
 
371 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.881632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1023  fatty acid desaturase family proteiin  23.28 
 
 
371 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2718  fatty acid desaturase  30.82 
 
 
396 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3432  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.820989  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1655  fatty acid desaturase  31.3 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156214  normal  0.387546 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>