16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3247 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3247  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 262 aa  540  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1860  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  76.54 
 
 		 262 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.688645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1987  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  76.54 
 
 		 262 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01930  possible peptidase  66.83 
 
 		 207 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2036  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.76 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1839  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.02 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.841987  normal  0.233297 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2189  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.08 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1788  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.96 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1710  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.11 
 
 		 399 aa  50.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.91 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.39 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.82 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.01 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.54 
 
 		 588 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.66 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.9 
 
 		 552 aa  42.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>