13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2348 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  24.83 
 
 		 483 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  24.83 
 
 		 483 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  25.38 
 
 		 846 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  25.82 
 
 		 492 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 1578 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  24.43 
 
 		 846 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 551 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  24.38 
 
 		 471 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  23.55 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 471 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  25.08 
 
 		 543 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  26.37 
 
 		 848 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>