175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2112 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181978  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  91.76 
 
 		 86 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000024687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  83.53 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000316075  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2175  cell division topological specificity factor MinE  82.35 
 
 		 85 aa  147  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000703577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2252  cell division topological specificity factor MinE  82.35 
 
 		 85 aa  147  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000226469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2384  cell division topological specificity factor MinE  82.35 
 
 		 85 aa  147  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000014177  normal  0.288717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2578  cell division topological specificity factor MinE  81.18 
 
 		 85 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1763  cell division topological specificity factor MinE  81.18 
 
 		 85 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2446  cell division topological specificity factor MinE  79.07 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000625931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2426  cell division topological specificity factor MinE  81.18 
 
 		 85 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000106409  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1866  cell division topological specificity factor MinE  81.18 
 
 		 85 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1893  cell division topological specificity factor MinE  81.18 
 
 		 85 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000138456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1900  cell division topological specificity factor MinE  81.18 
 
 		 85 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000310514  normal  0.522204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  80.95 
 
 		 86 aa  141  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1932  cell division topological specificity factor MinE  78.82 
 
 		 85 aa  140  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000555789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1627  cell division topological specificity factor MinE  74.42 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000660845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01606  cell division topological specificity factor MinE  62.79 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.38855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  57.65 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  58.82 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  57.65 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  55.29 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 83 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  56.63 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1958  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000738777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1317  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000676449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1955  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00065968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2373  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2015  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00111528  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1501  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00311098  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01149  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2474  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00314512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1327  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000455386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1938  cell division topological specificity factor MinE  61.9 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000167283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2451  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01159  hypothetical protein  60.71 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1274  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000236867  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1318  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000349629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1659  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1975  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2234  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000201972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1995  cell division topological specificity factor MinE  61.9 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0206269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  53.57 
 
 		 93 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2008  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2337  cell division topological specificity factor MinE  63.53 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1065  cell division topological specificity factor MinE  54.76 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00330436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  54.76 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2352  cell division topological specificity factor MinE  60.47 
 
 		 85 aa  94.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0614704  normal  0.0900841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2123  cell division topological specificity factor MinE  57.14 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2401  cell division topological specificity factor MinE  57.14 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000142715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2012  cell division topological specificity factor MinE  57.14 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  47.67 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  47.67 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1589  cell division topological specificity factor MinE  48.28 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.227403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2583  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2758  cell division topological specificity factor MinE  55.95 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000733452  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01383  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004088  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 		 87 aa  88.2  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  45.35 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1547  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000749363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04465  cell division topological specificity factor MinE  53.49 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1094  cell division topological specificity factor MinE  51.19 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0596  cell division topological specificity factor MinE  48.84 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.926303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  50.59 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0678  cell division topological specificity factor MinE  48.84 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  48.24 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1079  cell division topological specificity factor MinE  46.51 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000131881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3343  cell division topological specificity factor MinE  41.67 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1365  cell division topological specificity factor MinE  43.68 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  46.43 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  46.59 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  46.59 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0446  cell division topological specificity factor MinE  45.24 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.089748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0277  cell division topological specificity factor MinE  45.98 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.510649  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  45.35 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  42.35 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  42.35 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  44.59 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  45.45 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2034  cell division topological specificity factor MinE  44.83 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  43.53 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  43.53 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  43.53 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  43.53 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  44.44 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2972  cell division topological specificity factor MinE  40.7 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3563  cell division topological specificity factor MinE  45.88 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>