52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1691 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1691  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  100 
 
 		 432 aa  900    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2954  poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  59.31 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2320  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  47.13 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2002  peptidyl-dipeptidase A  45.77 
 
 		 465 aa  363  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1421  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  45.5 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1073  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  30.63 
 
 		 416 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0556378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0245  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.11 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0239  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.11 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.37 
 
 		 1168 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0301  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.73 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  25.07 
 
 		 1173 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  25.36 
 
 		 1157 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1960  teichoic acid biosynthesis protein F  26.52 
 
 		 721 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0738  CDP-glycerol glycerophosphotransferase  27.67 
 
 		 1229 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  25.85 
 
 		 1148 aa  77.4  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0300  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.05 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 		 1116 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0637  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.1 
 
 		 965 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1600  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.28 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.565675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0439  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  25.78 
 
 		 394 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0242  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.97 
 
 		 562 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0248  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.97 
 
 		 562 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2336  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 806 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1280  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.27 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0198  teichoic acid biosynthesis protein, putative  31.71 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.138456  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0244  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.5 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0238  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.5 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1523  glycosyl/glycerophosphate transferase  28.63 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00069495  normal  0.79532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14710  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  27.71 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1840  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.13 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3986  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  25.11 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  26.57 
 
 		 1169 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2210  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.32 
 
 		 777 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.918603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.66 
 
 		 970 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  23.03 
 
 		 946 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3544  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  25.66 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1574  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  23.64 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178333  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2178  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.12 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8378  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  25.88 
 
 		 931 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0707  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  22.39 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.645295  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase, putative  25.88 
 
 		 1098 aa  53.9  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.048897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  24.42 
 
 		 941 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0998  teichoic acid biosynthesis protein B  23.97 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0887389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1795  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  23.6 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.06439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2975  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  24.67 
 
 		 965 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.381876  normal  0.374774 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  21.86 
 
 		 856 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27900  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  22.47 
 
 		 1157 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0662  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  23.33 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.291082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0298  teichoic acid biosynthesis protein B, putative  23.26 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.473309  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0677  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  23.33 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14700  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  20.45 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310897 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1958  TagF domain-containing protein  23.41 
 
 		 559 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.651607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>