16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1354 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1252  hypothetical protein  80.28 
 
 		 71 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.745034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1160  hypothetical protein  67.61 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00416619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1241  hypothetical protein  66.67 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1319  hypothetical protein  68.85 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1310  hypothetical protein  68.85 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1346  hypothetical protein  68.85 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3040  hypothetical protein  68.85 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.975749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2460  hypothetical protein  61.97 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1146  hypothetical protein  75 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1487  hypothetical protein  76.47 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2764  hypothetical protein  71.15 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0224355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2455  hypothetical protein  49.23 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2940  hypothetical protein  52.78 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2842  hypothetical protein  58.73 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2284  hypothetical protein  43.1 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.115994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>