61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0950 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0950  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  254  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0848  hypothetical protein  98.39 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0819  hypothetical protein  89.52 
 
 
124 aa  234  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0765  hypothetical protein  87.9 
 
 
124 aa  229  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3513  protein of unknown function DUF1696  81.45 
 
 
124 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.10394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3704  hypothetical protein  81.45 
 
 
124 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0735  hypothetical protein  81.45 
 
 
124 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3796  hypothetical protein  80.65 
 
 
124 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0678  hypothetical protein  79.84 
 
 
125 aa  213  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3137  hypothetical protein  79.84 
 
 
124 aa  213  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0829  hypothetical protein  79.84 
 
 
124 aa  213  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0801  hypothetical protein  79.03 
 
 
124 aa  213  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3581  hypothetical protein  79.84 
 
 
124 aa  213  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3967  hypothetical protein  63.64 
 
 
124 aa  174  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2968  protein of unknown function DUF1696  55.37 
 
 
125 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000823184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4419  protein of unknown function DUF1696  54.55 
 
 
124 aa  157  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17100  Protein of unknown function (DUF1696)  52.46 
 
 
125 aa  154  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.319625 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00781  hypothetical protein  56.2 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.484953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1530  hypothetical protein  54.03 
 
 
125 aa  150  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2717  hypothetical protein  52.03 
 
 
125 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.518369  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1246  hypothetical protein  55 
 
 
125 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000430904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1850  hypothetical protein  52.85 
 
 
125 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.468949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4366  hypothetical protein  52.46 
 
 
125 aa  148  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2592  hypothetical protein  51.22 
 
 
125 aa  147  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0276501 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2698  hypothetical protein  52.03 
 
 
125 aa  146  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.929061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2513  hypothetical protein  52.03 
 
 
125 aa  146  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2439  hypothetical protein  52.03 
 
 
125 aa  146  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2474  hypothetical protein  52.03 
 
 
125 aa  146  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000514005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2712  hypothetical protein  52.03 
 
 
125 aa  146  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000335189 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2764  hypothetical protein  52.03 
 
 
125 aa  146  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.527603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2445  hypothetical protein  51.22 
 
 
125 aa  146  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00267859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3944  hypothetical protein  52.73 
 
 
124 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.195565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4312  protein of unknown function DUF1696  51.82 
 
 
124 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0773  hypothetical protein  53.72 
 
 
126 aa  139  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.39143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0224  hypothetical protein  49.6 
 
 
126 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5218  protein of unknown function DUF1696  47.71 
 
 
124 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454954  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1053  hypothetical protein  53.64 
 
 
125 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2961  hypothetical protein  47.71 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2100  protein of unknown function DUF1696  47.2 
 
 
126 aa  129  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320981  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1528  hypothetical protein  48.76 
 
 
126 aa  123  9e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00537923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0972  hypothetical protein  35.54 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1562  hypothetical protein  37.1 
 
 
127 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1634  protein of unknown function DUF1696  42.59 
 
 
124 aa  97.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11460  Protein of unknown function (DUF1696)  43.86 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0450  protein of unknown function DUF1696  42.15 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00191291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2096  protein of unknown function DUF1696  41.67 
 
 
125 aa  93.6  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00367109  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001163  GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1  33.33 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3190  protein of unknown function DUF1696  44.33 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000611457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1018  hypothetical protein  55.07 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1632  protein of unknown function DUF1696  40.4 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0378038 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04942  hypothetical protein  39.76 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2411  hypothetical protein  54.69 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.342791  normal  0.0159601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2235  protein of unknown function DUF1696  37.72 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0790271  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26210  Protein of unknown function (DUF1696)  44.16 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0252332  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4710  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4373  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000851345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2213  protein of unknown function DUF1696  34.72 
 
 
204 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4564  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4220  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4322  hypothetical protein  35.82 
 
 
204 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000820801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4595  hypothetical protein  35.82 
 
 
204 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000933479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>