More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0445 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03649  dihydroxy-acid dehydratase  78.34 
 
 		 616 aa  1004    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000570599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4205  dihydroxy-acid dehydratase  78.01 
 
 		 616 aa  1003    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00333285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3418  dihydroxy-acid dehydratase  66.56 
 
 		 620 aa  815    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4162  dihydroxy-acid dehydratase  94.81 
 
 		 616 aa  1181    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5128  dihydroxy-acid dehydratase  74.84 
 
 		 613 aa  948    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0070  dihydroxy-acid dehydratase  72.24 
 
 		 617 aa  900    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4231  dihydroxy-acid dehydratase  78.34 
 
 		 616 aa  1004    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4846  dihydroxy-acid dehydratase  78.37 
 
 		 620 aa  1004    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0807241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0485  dihydroxy-acid dehydratase  76.87 
 
 		 616 aa  981    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.543148 
 
 
-
 
NC_004310  BR0099  dihydroxy-acid dehydratase  72.29 
 
 		 611 aa  874    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0324836  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4345  dihydroxy-acid dehydratase  87.24 
 
 		 619 aa  1107    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5057  dihydroxy-acid dehydratase  75.32 
 
 		 615 aa  955    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0445  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 616 aa  1259    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  78.34 
 
 		 616 aa  1006    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4057  dihydroxy-acid dehydratase  76.87 
 
 		 616 aa  981    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0469  dihydroxy-acid dehydratase  75.32 
 
 		 615 aa  953    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1304  dihydroxy-acid dehydratase  70.47 
 
 		 628 aa  898    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0302  dihydroxy-acid dehydratase  74.31 
 
 		 618 aa  951    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000297284  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2209  dihydroxyacid dehydratase  66.02 
 
 		 625 aa  811    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5178  dihydroxy-acid dehydratase  75 
 
 		 613 aa  950    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2432  dihydroxy-acid dehydratase  72.07 
 
 		 619 aa  914    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4656  dihydroxy-acid dehydratase  72.85 
 
 		 617 aa  917    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  73.82 
 
 		 925 aa  926    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0213  dihydroxy-acid dehydratase  71.57 
 
 		 614 aa  881    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.450339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1121  dihydroxy-acid dehydratase  68.4 
 
 		 615 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4012  dihydroxy-acid dehydratase  78.01 
 
 		 616 aa  1001    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2001  dihydroxy-acid dehydratase  73.78 
 
 		 617 aa  936    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5358  dihydroxy-acid dehydratase  75.16 
 
 		 613 aa  953    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3074  dihydroxy-acid dehydratase  73.16 
 
 		 612 aa  904    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.611367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3737  dihydroxy-acid dehydratase  73.54 
 
 		 614 aa  919    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1899  dihydroxy-acid dehydratase  72.07 
 
 		 619 aa  919    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18498  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2756  dihydroxy-acid dehydratase  73.68 
 
 		 646 aa  927    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3612  dihydroxy-acid dehydratase  88.69 
 
 		 619 aa  1125    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4126  dihydroxy-acid dehydratase  87.66 
 
 		 624 aa  1121    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3925  dihydroxy-acid dehydratase  73.32 
 
 		 612 aa  906    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5002  dihydroxy-acid dehydratase  74.68 
 
 		 613 aa  946    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.138711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4452  dihydroxy-acid dehydratase  73.03 
 
 		 619 aa  927    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.941603 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0599  dihydroxy-acid dehydratase  72.24 
 
 		 617 aa  913    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0151535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2848  dihydroxy-acid dehydratase  72.67 
 
 		 609 aa  884    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.36735  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0336  dihydroxy-acid dehydratase  75 
 
 		 613 aa  949    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4029  dihydroxy-acid dehydratase  87.34 
 
 		 624 aa  1118    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0626  dihydroxy-acid dehydratase  74.15 
 
 		 619 aa  929    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546913  normal  0.890987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5433  dihydroxyacid dehydratase  73.69 
 
 		 613 aa  904    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535881  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1786  dihydroxyacid dehydratase  74.84 
 
 		 625 aa  912    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2723  dihydroxy-acid dehydratase  74.02 
 
 		 612 aa  923    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7305  dihydroxy-acid dehydratase  66.34 
 
 		 617 aa  789    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4515  dihydroxy-acid dehydratase  67.59 
 
 		 617 aa  826    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4066  dihydroxy-acid dehydratase  73.9 
 
 		 619 aa  935    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1784  dihydroxy-acid dehydratase  72.56 
 
 		 615 aa  912    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0157  dihydroxy-acid dehydratase  77.04 
 
 		 616 aa  983    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0358  dihydroxy-acid dehydratase  71.75 
 
 		 614 aa  903    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4321  dihydroxy-acid dehydratase  74.47 
 
 		 612 aa  915    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.169432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0340  dihydroxy-acid dehydratase  74.96 
 
 		 616 aa  956    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0348  dihydroxy-acid dehydratase  93.16 
 
 		 615 aa  1181    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2661  dihydroxy-acid dehydratase  72.33 
 
 		 620 aa  904    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3412  dihydroxy-acid dehydratase  84.63 
 
 		 619 aa  1054    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3037  dihydroxy-acid dehydratase  71.38 
 
 		 618 aa  871    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3804  dihydroxy-acid dehydratase  74.23 
 
 		 619 aa  936    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0169  dihydroxy-acid dehydratase  72.18 
 
 		 613 aa  872    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1074  dihydroxy-acid dehydratase  69.73 
 
 		 636 aa  896    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.413782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4585  dihydroxy-acid dehydratase  71.84 
 
 		 620 aa  902    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2486  dihydroxy-acid dehydratase  72.59 
 
 		 614 aa  904    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274808  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1189  dihydroxy-acid dehydratase  73.7 
 
 		 619 aa  930    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4231  dihydroxy-acid dehydratase  72.87 
 
 		 619 aa  925    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4250  dihydroxy-acid dehydratase  78.9 
 
 		 615 aa  985    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0971242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2666  dihydroxy-acid dehydratase  74.07 
 
 		 611 aa  906    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0342  dihydroxy-acid dehydratase  77.04 
 
 		 611 aa  965    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0292  dihydroxy-acid dehydratase  88.96 
 
 		 616 aa  1139    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0364  dihydroxy-acid dehydratase  87.56 
 
 		 619 aa  1111    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3662  dihydroxy-acid dehydratase  87.4 
 
 		 619 aa  1111    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0418  dihydroxyacid dehydratase  73.1 
 
 		 617 aa  917    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0213625  decreased coverage  0.00250401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1231  dihydroxy-acid dehydratase  66.4 
 
 		 638 aa  841    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00143562  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0424  dihydroxy-acid dehydratase  86.08 
 
 		 619 aa  1058    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0112  dihydroxy-acid dehydratase  72.93 
 
 		 611 aa  897    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3546  dihydroxy-acid dehydratase  72.71 
 
 		 619 aa  920    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04630  dihydroxy-acid dehydratase  75.16 
 
 		 612 aa  946    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  81.2 
 
 		 599 aa  1005    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3988  dihydroxy-acid dehydratase  78.34 
 
 		 616 aa  1004    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0446  dihydroxy-acid dehydratase  75 
 
 		 612 aa  944    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4135  dihydroxy-acid dehydratase  72.87 
 
 		 619 aa  925    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0713209  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1382  dihydroxy-acid dehydratase  71.41 
 
 		 634 aa  909    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.469767  hitchhiker  0.0000362711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1909  dihydroxy-acid dehydratase  66.23 
 
 		 619 aa  800    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1838  dihydroxyacid dehydratase  69.58 
 
 		 621 aa  882    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0358  dihydroxy-acid dehydratase  87.56 
 
 		 619 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4282  dihydroxy-acid dehydratase  78.34 
 
 		 616 aa  1005    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0097  dihydroxy-acid dehydratase  72.45 
 
 		 613 aa  875    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2675  dihydroxy-acid dehydratase  73.37 
 
 		 611 aa  879    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.272323 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2933  dihydroxy-acid dehydratase  73.98 
 
 		 612 aa  903    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4205  dihydroxy-acid dehydratase  74.68 
 
 		 612 aa  931    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3279  dihydroxy-acid dehydratase  84.76 
 
 		 618 aa  1085    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0346  dihydroxy-acid dehydratase  76.1 
 
 		 612 aa  972    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1161  dihydroxy-acid dehydratase  64.45 
 
 		 613 aa  756    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2423  dihydroxy-acid dehydratase  75.16 
 
 		 611 aa  922    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.421855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4007  dihydroxy-acid dehydratase  87.66 
 
 		 624 aa  1120    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1506  dihydroxy-acid dehydratase  73.35 
 
 		 619 aa  937    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5171  dihydroxy-acid dehydratase  64.83 
 
 		 613 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2491  dihydroxy-acid dehydratase  78.54 
 
 		 613 aa  996    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1072  dihydroxy-acid dehydratase  71.86 
 
 		 618 aa  914    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4757  dihydroxy-acid dehydratase  78.66 
 
 		 616 aa  999    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0890902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3801  dihydroxy-acid dehydratase  73.16 
 
 		 612 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.120257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>