More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2282 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2282  IS66 Orf2 like  100 
 
 
117 aa  243  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.915115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2202  IS66 Orf2 like  85.47 
 
 
117 aa  215  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2210  IS66 Orf2 like  85.47 
 
 
117 aa  215  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.584278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0202  IS66 Orf2 family protein  71.43 
 
 
118 aa  179  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00976284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0703  IS66 Orf2 family protein  71.43 
 
 
118 aa  179  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000158593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2338  IS66 Orf2 like  71.19 
 
 
118 aa  167  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2983  IS66 Orf2 family protein  67.89 
 
 
109 aa  166  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3053  IS66 Orf2 family protein  66.97 
 
 
109 aa  165  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0611  IS66 Orf2 family protein  53.21 
 
 
114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0639  IS66 Orf2 family protein  53.21 
 
 
114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0516  IS66 Orf2 like  49.56 
 
 
118 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000107243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2969  IS66 Orf2 family protein  45.3 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2706  IS66 Orf2 family protein  45.3 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0242768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2626  IS66 Orf2 family protein  45.3 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1835  IS66 Orf2 family protein  45.3 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170818  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1784  IS66 Orf2 family protein  47.86 
 
 
118 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1535  IS66 Orf2 family protein  47.01 
 
 
118 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1438  IS66 Orf2 family protein  42.37 
 
 
120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4533  IS66 Orf2 family protein  44.55 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2522  IS66 Orf2 family protein  45.05 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0065  transposase  41.88 
 
 
118 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1411  IS66 Orf2 family protein  46.46 
 
 
116 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3091  IS66 Orf2 family protein  46.46 
 
 
116 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292873  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2621  IS66 Orf2 family protein  44.55 
 
 
119 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0157656  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2651  IS66 Orf2 family protein  44.55 
 
 
119 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110169  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6338  IS66 Orf2 like  42 
 
 
117 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1275  IS66 Orf2 like  43.64 
 
 
119 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0748558  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  41 
 
 
116 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1617  IS66 Orf2 family protein  43.12 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.841823  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1004  IS66 Orf2 family protein  43.12 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6182  IS66 Orf2 like  42 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0643  IS66 Orf2 family protein  46.74 
 
 
117 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.237519  normal  0.0166652 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  42 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0928  IS66 Orf2 family protein  46.74 
 
 
117 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0189204  normal  0.805776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6578  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6339  IS66 Orf2 family protein  39.81 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  39.81 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3966  ISPsy5, Orf1  43.12 
 
 
119 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3221  ISPsy5, Orf1  40.17 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0651987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4793  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1718  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0521  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0155  hypothetical protein  44 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0036  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0040  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0197  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0669  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0842  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1017  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1019  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1099  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1190  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1226  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2436  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2461  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0245256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2839  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00396597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2970  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0658075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3212  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.071716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3215  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3612  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3652  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3997  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3998  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4252  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4390  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4566  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4694  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4738  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0621301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4765  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4995  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5213  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5214  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5305  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5367  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.450388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5412  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5444  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5544  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5590  ISPsy5, Orf1  42.2 
 
 
119 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2629  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396747  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2633  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180347  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2664  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.553305  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4024  ISPpu15, transposase Orf1  40.37 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4746  ISPpu15, transposase Orf1  40.37 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237213  hitchhiker  0.00598582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2392  ISPsy5, Orf1  41.28 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00116713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0320  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000227247  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0323  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000316141  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0475  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0129202  normal  0.393615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0661  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00198496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0678  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000411933  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1791  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163942  normal  0.445936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1975  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00703448  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2185  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000012204  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2191  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378167  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3293  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 
119 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000889246  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0638  ISPpu15, transposase Orf1  40.37 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0290  transposase  38.14 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4092  ISPpu15, transposase Orf1  40.37 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1715  transposase  38.14 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2461  transposase  38.14 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2952  transposase  38.14 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>