More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2210 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2202  IS66 Orf2 like  100 
 
 		 117 aa  243  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2210  IS66 Orf2 like  100 
 
 		 117 aa  243  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.584278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2282  IS66 Orf2 like  85.47 
 
 		 117 aa  215  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.915115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0202  IS66 Orf2 family protein  75.63 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00976284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0703  IS66 Orf2 family protein  75.63 
 
 		 118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000158593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2338  IS66 Orf2 like  71.19 
 
 		 118 aa  164  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2983  IS66 Orf2 family protein  70.75 
 
 		 109 aa  163  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3053  IS66 Orf2 family protein  69.81 
 
 		 109 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0516  IS66 Orf2 like  50.44 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000107243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2969  IS66 Orf2 family protein  47.86 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1835  IS66 Orf2 family protein  47.86 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2626  IS66 Orf2 family protein  47.86 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2706  IS66 Orf2 family protein  47.86 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0242768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0639  IS66 Orf2 family protein  51.85 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0611  IS66 Orf2 family protein  51.85 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1784  IS66 Orf2 family protein  47.01 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1535  IS66 Orf2 family protein  47.01 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1438  IS66 Orf2 family protein  44.86 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4533  IS66 Orf2 family protein  45.05 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2522  IS66 Orf2 family protein  45.95 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0065  transposase  43.75 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  43.43 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2621  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0157656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2651  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6182  IS66 Orf2 like  45.45 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1411  IS66 Orf2 family protein  43.43 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3091  IS66 Orf2 family protein  43.43 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6578  IS66 Orf2 family protein  42.42 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6338  IS66 Orf2 like  41.41 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0155  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6339  IS66 Orf2 family protein  40.57 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1275  IS66 Orf2 like  43.12 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0748558  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  42.42 
 
 		 116 aa  94  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1004  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1617  IS66 Orf2 family protein  42.2 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.841823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3966  ISPsy5, Orf1  45.37 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  42.42 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3113  ISPpu13, transposase Orf1  44.44 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3986  ISPpu13, transposase Orf1  44.44 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3221  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0651987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3637  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4115  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3085  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.325367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1718  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4793  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0521  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0037  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0161  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0106398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0432  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0435  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.566567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1049  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0743171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1164  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0832363  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1549  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.555012  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1989  IS66 Orf2 family protein  43.52 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.228694 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0928  IS66 Orf2 family protein  46.74 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0189204  normal  0.805776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0643  IS66 Orf2 family protein  46.74 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.237519  normal  0.0166652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0079  hypothetical protein  39.05 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2549  putative IS66 transposase, TnpB  39.05 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3737  putative transposase  39.05 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4092  ISPpu15, transposase Orf1  41.67 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5371  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.018412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4024  ISPpu15, transposase Orf1  41.67 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4746  ISPpu15, transposase Orf1  41.67 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237213  hitchhiker  0.00598582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2392  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00116713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0638  ISPpu15, transposase Orf1  41.67 
 
 		 118 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0036  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0040  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0197  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0669  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0842  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1017  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1019  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1099  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1190  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1226  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2436  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2461  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0245256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2839  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00396597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2970  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0658075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3212  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.071716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3215  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3612  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3652  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3997  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3998  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4252  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4390  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4566  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4694  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4738  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0621301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4765  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4995  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5213  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5214  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5305  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5367  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.450388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5412  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5444  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5544  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5590  ISPsy5, Orf1  43.52 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>