17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2201 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2201  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  216  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2209  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  216  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.758292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2283  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0702  hypothetical protein  42.11 
 
 
101 aa  87  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000842006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0203  hypothetical protein  42.11 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00930199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2339  hypothetical protein  39.81 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2984  putative transposase orf1 for insertion sequence element  23.81 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00919118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0630  hypothetical protein  36.9 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0314833  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3052  hypothetical protein  22.86 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0517  hypothetical protein  22.43 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000625521  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1834  hypothetical protein  21.57 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00046104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2625  hypothetical protein  21.57 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2705  hypothetical protein  21.57 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2968  hypothetical protein  21.57 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.061041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1439  hypothetical protein  22.22 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2653  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00867163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  27.93 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>