More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1952 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1952  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3475  ABC transporter related  67.63 
 
 		 243 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0335  ABC transporter related  45.91 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0378349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 630 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  40.34 
 
 		 605 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  42.53 
 
 		 284 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  41.67 
 
 		 497 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  39.83 
 
 		 571 aa  171  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  38.79 
 
 		 568 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  38.24 
 
 		 574 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 398 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  38.63 
 
 		 288 aa  166  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.69 
 
 		 274 aa  164  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0006  ABC transporter related  40.17 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.257411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  43.22 
 
 		 557 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  40.09 
 
 		 478 aa  161  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  35.54 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  42.29 
 
 		 553 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  41.23 
 
 		 574 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  40.89 
 
 		 458 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  42.79 
 
 		 531 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  39.51 
 
 		 569 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  37.9 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  39.51 
 
 		 569 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.98 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 568 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  39.92 
 
 		 576 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.9 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.9 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  37.83 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.9 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.9 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.32 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 		 509 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  40.91 
 
 		 541 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.9 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.59 
 
 		 395 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  40.18 
 
 		 528 aa  155  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 		 280 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 		 280 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 491 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.01 
 
 		 479 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  37.7 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.75 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.4 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 491 aa  152  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  40.18 
 
 		 277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.28 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  38.08 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  36.91 
 
 		 641 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.62 
 
 		 276 aa  151  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 489 aa  151  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.07 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  38.89 
 
 		 543 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  38.57 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  38.63 
 
 		 548 aa  149  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.89 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.29 
 
 		 278 aa  148  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  36.24 
 
 		 493 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  40 
 
 		 571 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.78 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  38.36 
 
 		 510 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  37.07 
 
 		 501 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 		 566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  36.99 
 
 		 501 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 		 566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 518 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  37.79 
 
 		 585 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.09 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  34.17 
 
 		 593 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 		 566 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  34.45 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.62 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 		 406 aa  145  5e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 530 aa  145  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1962  ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.76 
 
 		 267 aa  144  9e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  35.4 
 
 		 481 aa  144  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.8 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.96 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  41.38 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 		 566 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12820  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.05 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  44.02 
 
 		 534 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.22 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.84 
 
 		 403 aa  143  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  36.32 
 
 		 647 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.77 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 566 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 566 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>