296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1160 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1160  phosphorylase family 2 protein  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00784957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1847  purine phosphorylase family 2  48.33 
 
 
283 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  30.57 
 
 
261 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  34.76 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2403  methylthioadenosine phosphorylase  30.53 
 
 
276 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  29.04 
 
 
260 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  33.88 
 
 
268 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  29.93 
 
 
263 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  31.77 
 
 
263 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  30.69 
 
 
258 aa  95.5  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  27.53 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  30.61 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  30.48 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  29.96 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  23.75 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  27.39 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  25.55 
 
 
262 aa  89  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0182  methylthioadenosine phosphorylase  29.41 
 
 
254 aa  89  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00638501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1131  purine phosphorylase family 2  28.38 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  28.82 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  24.63 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1187  purine phosphorylase family 2  34.72 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  27.4 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  35.57 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1526  purine nucleoside phosphorylase  30.57 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1491  methylthioadenosine phosphorylase  34.23 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  35.57 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1225  purine phosphorylase family 2  29.61 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.338671  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0134  purine phosphorylase family 2  29.52 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0264  purine nucleoside phosphorylase  28.44 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  26.45 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  30.18 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  24.81 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2785  purine nucleoside phosphorylase  27.57 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000440392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  30.05 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0780  purine or other phosphorylase family 1  29.87 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.863354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  31.42 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  31.42 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  26.38 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3917  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  28.76 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3827  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4155  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3996  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.687151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3843  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  31.84 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4196  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00267818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  31.9 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4308  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4219  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1041  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00686248  hitchhiker  0.0000807252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4110  purine nucleoside phosphorylase  26.67 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.82826e-41 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  25.64 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  24.59 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  31.84 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1012  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  25.86 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0663  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  30.56 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0601397  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0573  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  26.46 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  29.96 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  29.45 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08880  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  26.2 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00712876  normal  0.676601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0777  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  27.88 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  29.45 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  29.45 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1201  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  26.75 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  30.49 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  26.94 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06960  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  26.67 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  29.37 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3656  purine nucleoside phosphorylase  26.43 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  28.16 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0618  inosine, guanosine, xanthosine phosphorylase  32.7 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  26.8 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1022  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  32.89 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3148  purine nucleoside phosphorylase  30.41 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  30.41 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  32.03 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  27.81 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1607  purine nucleoside phosphorylase  26.49 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3341  purine nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0369  purine nucleoside phosphorylase  29.65 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1783  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  24.03 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1523  5'-methylthioadenosine phosphorylase  29.96 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1196  purine nucleoside phosphorylase  27.57 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0130681  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0630  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  30.32 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  28.74 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  25.53 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14550  5'-methylthioadenosine phosphorylase  28.63 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2255  purine nucleoside phosphorylase  26.79 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  28.74 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  25.45 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  31.37 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4175  purine nucleoside phosphorylase  26.19 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  30.07 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2504  purine nucleoside phosphorylase  26.41 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138401  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  25.45 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  27.13 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1889  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  30.12 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000110705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1610  purine nucleoside phosphorylase  34.4 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1389  purine nucleoside phosphorylase  25.41 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>