30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0096 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0096  HD superfamily hydrolase  100 
 
 		 174 aa  360  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0234  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 		 162 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.588097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0150  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1275  HDIG domain-containing protein  35.54 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000140423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1097  HDIG/HD domain-containing protein  35.54 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0043379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1329  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0394567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27100  uncharacterized domain HDIG-containing protein  36.25 
 
 		 160 aa  91.3  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1183  metal-dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  35.53 
 
 		 969 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  30.09 
 
 		 540 aa  44.3  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  36.36 
 
 		 914 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  47.06 
 
 		 521 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  40.35 
 
 		 931 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  28.57 
 
 		 837 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  38.6 
 
 		 932 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  38.6 
 
 		 933 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  34.18 
 
 		 707 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  28.57 
 
 		 837 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  28.57 
 
 		 837 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  35.21 
 
 		 938 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  30.21 
 
 		 943 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.71 
 
 		 571 aa  42.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  37.88 
 
 		 912 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  36.84 
 
 		 933 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 217 aa  42  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  36.84 
 
 		 925 aa  42  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  31.13 
 
 		 935 aa  41.6  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  38.6 
 
 		 931 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  30.83 
 
 		 898 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 498 aa  40.8  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>