12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5205 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5205    100 
 
 		 150 bp  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.32096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  88.68 
 
 		 237 bp  58  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  88.68 
 
 		 237 bp  58  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  85.94 
 
 		 237 bp  56  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  84.62 
 
 		 237 bp  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  93.55 
 
 		 240 bp  46.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  83.33 
 
 		 237 bp  44.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  83.33 
 
 		 237 bp  44.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  83.87 
 
 		 237 bp  44.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  83.87 
 
 		 237 bp  44.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  83.87 
 
 		 237 bp  44.1  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  83.87 
 
 		 237 bp  44.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>