21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5028 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5028  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.284216  normal  0.520699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  43.31 
 
 		 590 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  42.18 
 
 		 540 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 551 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  49.33 
 
 		 565 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  58.93 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  47.27 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  61.54 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3120  recombinase  48.44 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.964732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  29.75 
 
 		 561 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1708  hypothetical protein  74.19 
 
 		 31 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  53.85 
 
 		 537 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0630  resolvase  57.14 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 		 517 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  33.94 
 
 		 555 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 542 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  34.45 
 
 		 546 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 554 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  50 
 
 		 518 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 445 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 445 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>