247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3926 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3926  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 512 aa  1023    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 578 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 592 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 603 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 596 aa  97.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 593 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 593 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 597 aa  94.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 662 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 585 aa  90.5  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 613 aa  72  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 964 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 1253 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 682 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 834 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 991 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  35.2 
 
 		 1248 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 1560 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 1093 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 681 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 1093 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.51 
 
 		 1668 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 674 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 941 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 732 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 771 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.15 
 
 		 1663 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  31.38 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  27.93 
 
 		 744 aa  62  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  29.86 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 704 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1210 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 732 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  32.28 
 
 		 918 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 872 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 819 aa  60.1  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1182 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  32 
 
 		 945 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  25.97 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 1714 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 932 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 839 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 727 aa  58.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 1183 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.58 
 
 		 783 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 1177 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 693 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  30.99 
 
 		 650 aa  57  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.25 
 
 		 754 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.52 
 
 		 381 aa  57  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 3706 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  30.65 
 
 		 676 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  49.25 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 511 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 1093 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 723 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 1676 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  28.83 
 
 		 657 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 585 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 892 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 368 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 747 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 807 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  42.31 
 
 		 366 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 366 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 358 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  27.52 
 
 		 624 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 358 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 414 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 616 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 272 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 541 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 832 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 1051 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 1654 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>