More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3730 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3730  catalase  100 
 
 		 506 aa  1056    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0449  Catalase  64.32 
 
 		 485 aa  636    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  76.57 
 
 		 499 aa  795    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22460  catalase  66.18 
 
 		 499 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04660  catalase  70.42 
 
 		 504 aa  716    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651811  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09640  catalase  67.79 
 
 		 535 aa  710    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023552  normal  0.0698912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24970  catalase  69.56 
 
 		 497 aa  703    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2517  Catalase  63.94 
 
 		 509 aa  637    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  76.21 
 
 		 555 aa  788    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1308  catalase  64.42 
 
 		 480 aa  646    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0803  catalase  64.08 
 
 		 487 aa  664    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0804  catalase  82.72 
 
 		 499 aa  868    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0843  catalase  82.72 
 
 		 499 aa  868    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1629  Catalase  63.01 
 
 		 508 aa  635    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.303359  normal  0.0939595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3238  Catalase  65.55 
 
 		 510 aa  638    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.067006 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1236  Catalase  64.8 
 
 		 483 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0619868  normal  0.69126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5493  catalase  63.39 
 
 		 482 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.620099  normal  0.0567456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  63.75 
 
 		 500 aa  632  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2094  catalase  65.52 
 
 		 482 aa  630  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.615987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6791  catalase  62.94 
 
 		 507 aa  627  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  62.08 
 
 		 487 aa  625  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  61.57 
 
 		 499 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  61.67 
 
 		 494 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1101  Catalase  62.11 
 
 		 481 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.384767  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0222  Catalase  62.32 
 
 		 484 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0236  catalase  57.45 
 
 		 482 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  55.49 
 
 		 483 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  52.85 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  52.43 
 
 		 479 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  51.77 
 
 		 498 aa  502  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  52.43 
 
 		 479 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  54.89 
 
 		 485 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  52.22 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  51.46 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  52.11 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  52.19 
 
 		 487 aa  488  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  50.84 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  51.55 
 
 		 485 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  50.41 
 
 		 499 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  52.03 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  52.03 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  49.9 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  50 
 
 		 490 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  50.21 
 
 		 547 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  49.48 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  50.7 
 
 		 501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  49.69 
 
 		 486 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  49.69 
 
 		 486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  50.1 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  49.48 
 
 		 486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  48.86 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3054  catalase  49.37 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  49.28 
 
 		 491 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2262  catalase-like  49.79 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  51.58 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  50.9 
 
 		 501 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  50.21 
 
 		 496 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  50.11 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  51.58 
 
 		 488 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  50.42 
 
 		 480 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  49.28 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  47.27 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  49.18 
 
 		 488 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0269  catalase  49.9 
 
 		 504 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146052  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0322  catalase  49.37 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  49.68 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  49.28 
 
 		 486 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  49.04 
 
 		 479 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  49.69 
 
 		 490 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  50 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  49.79 
 
 		 485 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  50.11 
 
 		 483 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  49.69 
 
 		 486 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  49.69 
 
 		 483 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  49.79 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0355  catalase  49.16 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.692778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  49.48 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  48.62 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  49.49 
 
 		 490 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  48.65 
 
 		 491 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0383  catalase  49.16 
 
 		 494 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  49.49 
 
 		 490 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  49.17 
 
 		 487 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  49.79 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  51.62 
 
 		 487 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  50.64 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1958  catalase  49.69 
 
 		 483 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  48.97 
 
 		 485 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  48.16 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  48.55 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  50.21 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2489  catalase  50.1 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.350666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  49.07 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  47.61 
 
 		 482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  48.64 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  48.52 
 
 		 483 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  47.39 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  49.04 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  47.4 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  48.83 
 
 		 486 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>