10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3191 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3191  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 		 1531 aa  2877    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.670297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2382  hypothetical protein  37.81 
 
 		 3069 aa  149  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1988  hypothetical protein  39.22 
 
 		 2615 aa  142  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0350  hypothetical protein  38.03 
 
 		 2090 aa  123  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.279017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.83 
 
 		 1148 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  29.83 
 
 		 991 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.33 
 
 		 2751 aa  48.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  28.98 
 
 		 1169 aa  45.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  31.33 
 
 		 1003 aa  45.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.66 
 
 		 985 aa  45.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>