13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1813 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1813  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  337  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2175  hypothetical protein  32.84 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3904  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0783723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  27.74 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688301  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  31.54 
 
 		 129 aa  52  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  25.53 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0103  hypothetical protein  26.62 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  24.63 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  25.78 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  25.31 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  25.55 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  31.03 
 
 		 135 aa  41.2  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  27.27 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>