More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0892 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0892  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  100 
 
 
492 aa  1024    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585089  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  32.44 
 
 
505 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1698  putative monooxygenase  32.91 
 
 
508 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.647654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3698  putative monooxygenase  32.16 
 
 
529 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.291141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  32.24 
 
 
496 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  32.59 
 
 
525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 
529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  31.75 
 
 
487 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.52 
 
 
485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  31.56 
 
 
508 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  32.21 
 
 
531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  29.69 
 
 
513 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  31.11 
 
 
517 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  31.98 
 
 
527 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  30.06 
 
 
490 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
533 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.19 
 
 
506 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  31.77 
 
 
514 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2987  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
493 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3031  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
493 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3002  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.58 
 
 
493 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558495  normal  0.0447488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
520 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.4 
 
 
488 aa  236  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  30.57 
 
 
529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13950  predicted flavoprotein involved in K+ transport  30.32 
 
 
505 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52732  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2048  flavin-containing monooxygenase FMO  31.99 
 
 
484 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  31.34 
 
 
487 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  31.34 
 
 
487 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  30.51 
 
 
529 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
525 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  30.36 
 
 
526 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  30.51 
 
 
526 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249427 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  30.85 
 
 
526 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  30.85 
 
 
526 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.48 
 
 
484 aa  230  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1205  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  32.89 
 
 
505 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3819  cyclohexanone monooxygenase  29.02 
 
 
527 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  30.44 
 
 
524 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0895  cyclohexanone monooxygenase  30 
 
 
491 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  30.92 
 
 
491 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3203  putative monooxygenase  30.2 
 
 
505 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0255813  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  30.2 
 
 
505 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  30 
 
 
529 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3194  putative monooxygenase  30.2 
 
 
505 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  30 
 
 
529 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  30 
 
 
529 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  30 
 
 
524 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  29.67 
 
 
491 aa  223  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  29.51 
 
 
565 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  30.63 
 
 
524 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  29.79 
 
 
529 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3628  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
487 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0678388  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  31.52 
 
 
499 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  30.95 
 
 
489 aa  219  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6774  flavin-containing monooxygenase FMO  30.37 
 
 
464 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.651237  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3104  cyclohexanone monooxygenase  30.42 
 
 
494 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452732  normal  0.352064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  30.17 
 
 
548 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  30.17 
 
 
540 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  26.65 
 
 
493 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  30.02 
 
 
524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  29.15 
 
 
570 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.81 
 
 
495 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.67 
 
 
818 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.89 
 
 
816 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  31 
 
 
524 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
556 aa  213  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.36 
 
 
500 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3204  putative monooxygenase  30.86 
 
 
495 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11246  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3257  putative monooxygenase  30.86 
 
 
497 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852891  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3195  putative monooxygenase  30.86 
 
 
497 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3708  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
494 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0275457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3444  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.6 
 
 
491 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3372  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.09 
 
 
493 aa  210  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.057786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  29.36 
 
 
488 aa  209  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  29.53 
 
 
514 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.93 
 
 
816 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1366  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.98 
 
 
493 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
483 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  30.39 
 
 
816 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  32.55 
 
 
529 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4177  cyclohexanone monooxygenase  28.69 
 
 
503 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  28.97 
 
 
496 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  28.72 
 
 
490 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3377  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
494 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.968772  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.74 
 
 
816 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  28.66 
 
 
503 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.25 
 
 
494 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  30.77 
 
 
491 aa  202  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  28.57 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  29.34 
 
 
479 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  29.18 
 
 
496 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.81 
 
 
495 aa  200  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0504093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
484 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0551  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.8 
 
 
496 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.635944  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.8 
 
 
496 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.230445  hitchhiker  0.00837864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.8 
 
 
496 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  30.73 
 
 
492 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4132  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
498 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>