More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0712 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0712  aldo/keto reductase  100 
 
 		 380 aa  781    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000693877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1982  aldo/keto reductase family protein  50.89 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.454617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1528  aldo/keto reductase  38.64 
 
 		 339 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.162616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42373  predicted protein  35.73 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71632  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0767  aldo/keto reductase  36.39 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  35.88 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31589  predicted protein  43.23 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231835  normal  0.784447 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08658  conserved hypothetical protein  32.21 
 
 		 463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  28.11 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  26.97 
 
 		 331 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  27.19 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  25.56 
 
 		 274 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  25.56 
 
 		 274 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  27.41 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0026  hypothetical protein  28.25 
 
 		 325 aa  96.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.23 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  27.41 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  27.39 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  28.96 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  28.9 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  26.76 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  28.66 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  27.17 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  29.83 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  28.81 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  29.83 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  26.25 
 
 		 333 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  29.82 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  26.6 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  27.73 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  27.55 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  27.24 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  29.49 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  25 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  24.84 
 
 		 328 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  26.32 
 
 		 350 aa  90.1  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  25.9 
 
 		 351 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  25.9 
 
 		 351 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  26.94 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  26.91 
 
 		 327 aa  89.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  26.22 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  28.05 
 
 		 281 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  29.21 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  26.56 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0644  aldo/keto reductase  26.07 
 
 		 315 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282625  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  27.87 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  30.22 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  28.03 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  27.25 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  26.02 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  27.36 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.25 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  27.76 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1120  aldo/keto reductase  27.73 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00427173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  27.67 
 
 		 325 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  26.52 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  25.9 
 
 		 351 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  28.76 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  26.6 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  28.76 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  28.76 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  25 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  27.86 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  26.91 
 
 		 345 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  28.52 
 
 		 342 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  27.79 
 
 		 321 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  28.93 
 
 		 332 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  28.03 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  29.39 
 
 		 344 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  27.87 
 
 		 341 aa  86.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  25.82 
 
 		 342 aa  86.3  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  26.89 
 
 		 344 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  24.24 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  29.41 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  26.84 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  26.32 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  31.58 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5935  aldo/keto reductase  27.66 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431084  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  27.67 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16993  predicted protein  28.48 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  26.52 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  26.91 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1316  aldo/keto reductase  25.07 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  26.73 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  26.22 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.14 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.67 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  27.91 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  24.26 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  26.35 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  27.39 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.76 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  27.68 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  30.51 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  26.28 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  27.36 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  26.71 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  27.33 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  27.33 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>