More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0051 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0051  cysteine desulfurase  100 
 
 		 352 aa  677    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0157831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2798  aminotransferase, class V  58.62 
 
 		 348 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  44.68 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  44.41 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  36.94 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  41.71 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  41.71 
 
 		 392 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  37.57 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.52 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.43 
 
 		 402 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  42.74 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  35.7 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.4 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  42.25 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  39.04 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  43.01 
 
 		 347 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  43.16 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  37.37 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  39.4 
 
 		 380 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  42.22 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  43.88 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  42.6 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1592  Cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 378 aa  203  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  43.34 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  40.27 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  44.39 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  41.6 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  35.54 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  35.44 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.63 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  39.44 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  36.19 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  35.26 
 
 		 394 aa  195  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  35.42 
 
 		 389 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  44.35 
 
 		 390 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  40.53 
 
 		 390 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  36.13 
 
 		 386 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  41.33 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  35.54 
 
 		 414 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  39.04 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  42.9 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  34.71 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  39.35 
 
 		 1143 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  41.76 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  43.91 
 
 		 355 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  42.37 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  36.81 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 533 aa  187  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  31.32 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  35.66 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  36.81 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  37.67 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  41.57 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  33.7 
 
 		 530 aa  187  3e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  43.45 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  38.08 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2363  cysteine desulfurase  42.21 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  34.36 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  39.62 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  38.11 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  29.86 
 
 		 492 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  42.45 
 
 		 424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  32.81 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06940  cysteine desulfurase family protein  35.37 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.417246  normal  0.55711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  42.59 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1632  cysteine desulfurase  41.96 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.422734  hitchhiker  0.00000261738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  38.2 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  36.84 
 
 		 397 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1412  aminotransferase class V  40.26 
 
 		 391 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  33.69 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  43.45 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2797  aminotransferase, class V  43.02 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.095242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  36.63 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  39.02 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  39.3 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  38.07 
 
 		 1139 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 399 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  37.2 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1593  Cysteine desulfurase  42.3 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0523222  normal  0.508346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  37.6 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  32.45 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  32.89 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  34.77 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  43.45 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  33.69 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  35.25 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  39.11 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  32.89 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  39.62 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  35.44 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 381 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.84 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>