More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38240 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38240  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 342 aa  697    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6917  fructose-bisphosphate aldolase  81.87 
 
 		 344 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.593833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4782  fructose-bisphosphate aldolase, class II  78.53 
 
 		 344 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0178  fructose-bisphosphate aldolase  80.12 
 
 		 340 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.758493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0391  fructose-bisphosphate aldolase, class II  79.24 
 
 		 340 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0503  fructose-bisphosphate aldolase  74.27 
 
 		 345 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0492  fructose-bisphosphate aldolase  74.27 
 
 		 345 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0514  fructose-bisphosphate aldolase  74.27 
 
 		 345 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641702  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0207  fructose-bisphosphate aldolase, class II  76.61 
 
 		 340 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0234  fructose-bisphosphate aldolase  74.27 
 
 		 345 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.644584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0511  fructose-bisphosphate aldolase, class II  74.56 
 
 		 342 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2125  fructose-bisphosphate aldolase  76.02 
 
 		 342 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0670  fructose-bisphosphate aldolase  73.39 
 
 		 345 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0305767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3010  fructose-bisphosphate aldolase  75.44 
 
 		 340 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.406027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8387  fructose-bisphosphate aldolase  75.22 
 
 		 341 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4633  fructose-bisphosphate aldolase, class II  72.81 
 
 		 340 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.406507  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10368  fructose-bisphosphate aldolase  74.85 
 
 		 344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0217  fructose-bisphosphate aldolase  70.76 
 
 		 344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4124  fructose-bisphosphate aldolase  72.81 
 
 		 340 aa  514  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.493234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5147  fructose-bisphosphate aldolase  71.93 
 
 		 344 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4364  fructose-bisphosphate aldolase  73.39 
 
 		 345 aa  507  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00568724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0244  fructose-bisphosphate aldolase class II  72.27 
 
 		 341 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4350  fructose-bisphosphate aldolase  71.93 
 
 		 343 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4064  fructose-bisphosphate aldolase, class II  72.81 
 
 		 344 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0130  fructose-bisphosphate aldolase  70.76 
 
 		 340 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0135  fructose-bisphosphate aldolase  70.18 
 
 		 340 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05650  fructose-bisphosphate aldolase  69.97 
 
 		 346 aa  480  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.456555  normal  0.714487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0658  fructose-bisphosphate aldolase  67.54 
 
 		 339 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0518  fructose-bisphosphate aldolase  68.13 
 
 		 339 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3640  fructose-bisphosphate aldolase  67.84 
 
 		 340 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.679322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2968  fructose-bisphosphate aldolase, class II  66.96 
 
 		 340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.108432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2420  fructose-bisphosphate aldolase  66.08 
 
 		 340 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.968558  normal  0.228515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02060  fructose-bisphosphate aldolase  66.67 
 
 		 340 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3142  fructose-bisphosphate aldolase, class II  65.2 
 
 		 340 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0879085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35240  fructose-bisphosphate aldolase  65.2 
 
 		 340 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25740  fructose-bisphosphate aldolase  64.81 
 
 		 341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1348  fructose-bisphosphate aldolase  63.56 
 
 		 355 aa  441  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0114  fructose-bisphosphate aldolase, class II  57.71 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2153  fructose-bisphosphate aldolase, class II  59.88 
 
 		 341 aa  403  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1853  fructose-bisphosphate aldolase  57.97 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0721  fructose-bisphosphate aldolase  58.43 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1469  fructose-bisphosphate aldolase  60.47 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0227656 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1220  fructose-bisphosphate aldolase  44.97 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.781529  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1415  fructose-bisphosphate aldolase  42.12 
 
 		 359 aa  248  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0793639 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0515  fructose-bisphosphate aldolase  45.05 
 
 		 354 aa  248  9e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002473  fructose-bisphosphate aldolase class II  42.11 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1277  fructose-bisphosphate aldolase  42.06 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000957639  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0031  fructose-bisphosphate aldolase  41.23 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.218683  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0913  fructose-bisphosphate aldolase  43.82 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.906475  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0110  fructose-bisphosphate aldolase  41.52 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0206  fructose-bisphosphate aldolase  42.77 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0555  fructose-bisphosphate aldolase  41.54 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2070  fructose-bisphosphate aldolase  43.15 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0700  fructose-bisphosphate aldolase  41.94 
 
 		 354 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0625  fructose-bisphosphate aldolase  41.94 
 
 		 354 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.718371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3279  fructose-bisphosphate aldolase  41.4 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.032086  normal  0.0544122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1072  fructose-bisphosphate aldolase  41.64 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03564  fructose-bisphosphate aldolase  40.64 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0514  fructose-bisphosphate aldolase  41.25 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0646  fructose-bisphosphate aldolase  42.09 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.598975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1339  fructose-bisphosphate aldolase, class II  39.6 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3700  fructose-bisphosphate aldolase  39.71 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0372  fructose-bisphosphate aldolase  40.48 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0662896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3897  fructose-bisphosphate aldolase  39.42 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12268  fructose-bisphosphate aldolase  39.77 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0451  fructose-bisphosphate aldolase  40.65 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0113  fructose-bisphosphate aldolase  45.24 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0509  fructose-bisphosphate aldolase  41.16 
 
 		 357 aa  232  6e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0853  fructose-bisphosphate aldolase  41.42 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000607059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0850  fructose-bisphosphate aldolase  41.42 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.961226  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3817  fructose-bisphosphate aldolase  41.42 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3665  fructose-bisphosphate aldolase  40.18 
 
 		 355 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364616  normal  0.0396851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1463  fructose-bisphosphate aldolase  40.92 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3944  fructose-bisphosphate aldolase  40.83 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.910898 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02875  hypothetical protein similar to fructose 1,6-biphosphate aldolase (Eurofung)  41.64 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3350  fructose-bisphosphate aldolase  39.88 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02756  fructose-bisphosphate aldolase  39.88 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0768  fructose-bisphosphate aldolase, class II  39.88 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.366427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3083  fructose-bisphosphate aldolase  39.88 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29014  cytosolic class II aldolase  41.88 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4222  fructose-bisphosphate aldolase  39.88 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3253  fructose-bisphosphate aldolase  39.88 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.878891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0785  fructose-bisphosphate aldolase  39.88 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3062  fructose-bisphosphate aldolase  39.88 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.150625  normal  0.294869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3338  fructose-bisphosphate aldolase  40.24 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2688  fructose-bisphosphate aldolase  39.08 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.209388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3241  fructose-bisphosphate aldolase  39.6 
 
 		 359 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3410  fructose-bisphosphate aldolase  39.31 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3308  fructose-bisphosphate aldolase  39.31 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3305  fructose-bisphosphate aldolase  39.31 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0651227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3230  fructose-bisphosphate aldolase  39.31 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435272  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00300  fructose-bisphosphate aldolase, putative  40.57 
 
 		 359 aa  225  7e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000000441241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0557  fructose-bisphosphate aldolase  40.65 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22993  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.06 
 
 		 439 aa  219  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0254  fructose-bisphosphate aldolase, class II  39.03 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0117371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3060  fructose-bisphosphate aldolase  39.29 
 
 		 365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85951  fructose-bisphosphate aldolase  41.74 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94831  predicted protein  39.18 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.179075  normal  0.245403 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2168  fructose-bisphosphate aldolase  30.79 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00424601  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  30.61 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>