76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  100 
 
 		 253 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  50.4 
 
 		 256 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0322  hypothetical protein  48.9 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0384  hypothetical protein  46 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0634  putative integral membrane protein  41.37 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0194  protein of unknown function DUF540  39.43 
 
 		 283 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  41.18 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4000  protein of unknown function DUF540  40.25 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0202  protein of unknown function DUF540  35.32 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  41.96 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3323  protein of unknown function DUF540  36.84 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  28.11 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  31.51 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  29.63 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  27.02 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  27.02 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  27.02 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  30.2 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  31.37 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  31.58 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  24.8 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  30.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  30.73 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  30.73 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  30.73 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  30.73 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  30.73 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  24.6 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  28.49 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  29.03 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1712  putative sulfate transport protein CysZ  35.33 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  26.54 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  26.64 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  26.64 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  26.64 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  24.31 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  26.25 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  26.29 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03620  hypothetical protein  26.88 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  27.31 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  27.31 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1566  putative sulfate transport protein CysZ  27.31 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000261033  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  25.5 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  24.6 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  28.48 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  27.27 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  28.09 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  26.46 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  27.71 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1193  protein of unknown function DUF540  24.75 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.436714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3197  putative sulfate uptake protein  24.63 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1773  hypothetical protein  28.49 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3262  hypothetical protein  30.72 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0899601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  24.26 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  23.49 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  25.3 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  22.62 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  28.75 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  23.7 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  25.97 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4403  hypothetical protein  26.8 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1024  CysZ protein  28.4 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000955852  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  23.63 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1015  putative sulfate transport protein CysZ  24.58 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0976  putative sulfate transport protein CysZ  31.33 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828685  normal  0.13166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  29.33 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1177  cysZ protein  24.15 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>