66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17100  Protein of unknown function (DUF1696)  100 
 
 
125 aa  257  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.319625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4366  hypothetical protein  67.2 
 
 
125 aa  193  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1530  hypothetical protein  62.4 
 
 
125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2968  protein of unknown function DUF1696  59.2 
 
 
125 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000823184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2100  protein of unknown function DUF1696  56.8 
 
 
126 aa  159  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320981  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0950  hypothetical protein  52.46 
 
 
124 aa  154  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0819  hypothetical protein  52.46 
 
 
124 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0224  hypothetical protein  55.2 
 
 
126 aa  153  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0765  hypothetical protein  52.89 
 
 
124 aa  153  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0848  hypothetical protein  51.64 
 
 
124 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3513  protein of unknown function DUF1696  53.23 
 
 
124 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.10394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3704  hypothetical protein  53.23 
 
 
124 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0735  hypothetical protein  53.23 
 
 
124 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3796  hypothetical protein  52.42 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3581  hypothetical protein  53.23 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0678  hypothetical protein  52.42 
 
 
125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2592  hypothetical protein  53.6 
 
 
125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0276501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2445  hypothetical protein  53.6 
 
 
125 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00267859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2764  hypothetical protein  53.6 
 
 
125 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.527603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2717  hypothetical protein  52.8 
 
 
125 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.518369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2474  hypothetical protein  53.6 
 
 
125 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000514005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2439  hypothetical protein  53.6 
 
 
125 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3137  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0829  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2698  hypothetical protein  52.8 
 
 
125 aa  146  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.929061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2513  hypothetical protein  52.8 
 
 
125 aa  146  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2712  hypothetical protein  52.8 
 
 
125 aa  146  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000335189 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0801  hypothetical protein  49.19 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4419  protein of unknown function DUF1696  51.67 
 
 
124 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1850  hypothetical protein  51.2 
 
 
125 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.468949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3967  hypothetical protein  49.59 
 
 
124 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12915  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00781  hypothetical protein  57.84 
 
 
124 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.484953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5218  protein of unknown function DUF1696  52.38 
 
 
124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454954  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1528  hypothetical protein  50.4 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00537923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0773  hypothetical protein  49.21 
 
 
126 aa  130  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.39143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3944  hypothetical protein  54 
 
 
124 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.195565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4312  protein of unknown function DUF1696  54 
 
 
124 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1246  hypothetical protein  45.97 
 
 
125 aa  130  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000430904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1562  hypothetical protein  49.19 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2961  hypothetical protein  51.43 
 
 
124 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1053  hypothetical protein  51.75 
 
 
125 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0972  hypothetical protein  41.13 
 
 
121 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1634  protein of unknown function DUF1696  39.17 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936562  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1632  protein of unknown function DUF1696  47.47 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0378038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11460  Protein of unknown function (DUF1696)  38.6 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2096  protein of unknown function DUF1696  41.28 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00367109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1018  hypothetical protein  45 
 
 
115 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001163  GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1  36.04 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04942  hypothetical protein  44.58 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0450  protein of unknown function DUF1696  32.26 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00191291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3190  protein of unknown function DUF1696  42.57 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000611457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26210  Protein of unknown function (DUF1696)  44.55 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0252332  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2411  hypothetical protein  54.69 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.342791  normal  0.0159601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2235  protein of unknown function DUF1696  39.33 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0790271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4322  hypothetical protein  34.67 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000820801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4595  hypothetical protein  34.67 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000933479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4210  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4614  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4570  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.103016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4373  hypothetical protein  32 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000851345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4710  hypothetical protein  32 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0640  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00127243  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0414  protein of unknown function DUF1696  37.68 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4220  hypothetical protein  32 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4564  hypothetical protein  32 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2213  protein of unknown function DUF1696  31.58 
 
 
204 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>