12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00280  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  283  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.326036  normal  0.0617221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0015  hypothetical protein  39.26 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0011  hypothetical protein  33.07 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0019  hypothetical protein  33.07 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0189767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0011  hypothetical protein  33.07 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0030  hypothetical protein  47.5 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0024  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1681  hypothetical protein  39.34 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10010  hypothetical protein  30.53 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0022  hypothetical protein  32.05 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0018  hypothetical protein  31.5 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0816  hypothetical protein  28.12 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.711897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>